ఎమర్జెన్సీ మెడిసిన్: ఓపెన్ యాక్సెస్
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

హేమ్ ఆక్సిజనేస్ అనేది ఒక పరమాణు నియంత్రణ, ఇది మధుమేహంలో కార్డియో-మూత్రపిండ ఇబ్బందులను మెరుగుపరుస్తుంది

జోసెఫ్ F Ndisang

వియుక్త

ఇప్పటి వరకు  కెన్యాలో డయోస్కోరియా (యామ్స్) అనేది నిర్లక్ష్యం చేయబడిన పంటగా ఉంది, ఆహారంగా మరియు ఫార్మాస్యూటిక్స్‌లో ఔషధ మూలంగా దాని సంభావ్యత ఉన్నప్పటికీ. నిర్లక్ష్యానికి గురైన పంటలపై పరిశోధన ప్రత్యేకంగా డియోస్కోరియా శాస్త్రీయ సమాజాన్ని మరియు దాని గురించి విధాన రూపకర్తలను సున్నితం చేయడానికి ఒక ఖచ్చితమైన మార్గం. వివిధ జాతులకు చెందిన అనేక వైరస్‌లు యమ్ ( డయోస్కోరియా spp .) కు సోకినట్లు నివేదించబడ్డాయి . యమకు సోకే వైరస్ల పూర్తి వైవిధ్యం, అయితే, అన్వేషించవలసి ఉంది.

మొక్కలలో కొత్త మొక్కల వైరల్ జన్యువులు మరియు జీవక్రియ ప్రక్రియల ఆవిష్కరణలో హై-త్రూపుట్ సీక్వెన్సింగ్ (HTS) మరియు POX మార్కర్ పద్ధతుల ఉపయోగం క్రమంగా ఉపయోగించబడుతున్నాయి.

ఈ అధ్యయనంలో, యామ్ జెర్మ్‌ప్లాజమ్ యొక్క అంతర్జాతీయ పంపిణీని నిరోధించే ఏవైనా కనుగొనబడని వైరస్‌లు ఉన్నాయో లేదో తెలుసుకోవడానికి నేను యమ్‌పై HTSని ఉపయోగిస్తాను. కొత్త వైరస్ క్రమాన్ని కనుగొనడంలో ఈ అన్వేషణ పని చేస్తుంది. ముప్పై ఒకటి (31) యమ్ శాంపిల్స్ పరీక్షించబడతాయి మరియు తాత్కాలికంగా వైరస్ "యమ్ వైరస్ Y" (YVY) అని పేరు పెట్టబడ్డాయి . పెరాక్సిడేస్ మార్కర్ ఉపయోగించి మ్యుటేషన్‌ను తీసుకువచ్చే జీవక్రియ ప్రతిచర్యను పరీక్షించడం ద్వారా అవి జీవక్రియలో అరబియోడిసిస్ ప్రక్రియను సాధించడం ద్వారా పరీక్షించబడతాయి. జీవి. రెండు YVY వైరల్ ఐసోలేట్‌ల యొక్క పూర్తి జన్యు శ్రేణులు సమీకరించబడతాయి మరియు ఐదు ఓపెన్ రీడింగ్ ఫ్రేమ్‌లకు (ORFలు) టెక్స్ట్ చేయడానికి తదుపరి అన్వేషణ జరుగుతుంది. ORF1 ఒక పెద్ద రెప్లికేషన్-అనుబంధ ప్రోటీన్‌ను ఎన్కోడ్ చేస్తుంది, ORF2, ORF3 మరియు ORF4 పుటేటివ్ ట్రిపుల్ జీన్ బ్లాక్ ప్రోటీన్‌లను ఏర్పరుస్తాయి మరియు ORF5 ఒక పుటేటివ్ కోట్ ప్రోటీన్‌ను ఎన్కోడ్ చేస్తుంది, ఎందుకంటే యమ్‌లో డయోస్కోరిన్ ఉంటుంది, ఇది ప్రోటీన్‌తో నిండి ఉంటుంది. బీటాఫ్లెక్సివిరిడే కుటుంబం యొక్క జాతుల విభజన ప్రమాణాలను పరిశీలిస్తే, YVYని బీటాఫ్లెక్సివిరిడే కుటుంబంలో ఒక నవల వైరస్ జాతిగా పరిగణించాలి. ఈ కొత్త వైరస్ యొక్క ఏవైనా లక్షణాలతో అనుబంధం మరియు దిగుబడి నష్టం మరియు వైరస్ రహిత విత్తన యామ్ ఉత్పత్తిపై దాని చిక్కులను అర్థం చేసుకోవడానికి మరింత పని అవసరం.

కీవర్డ్లు: RNA-Seq; వైరస్ గుర్తింపు; Betaflexiviridae; తదుపరి తరం సీక్వెన్సింగ్; HTS

ఈ పనిని జూన్ 24-25, 2020న ఔషధ మొక్కలు మరియు సముద్ర ఔషధాలపై 6వ ప్రపంచ కాంగ్రెస్‌లో (ఔషధ మొక్కలు 2020- వెబ్‌నార్) ప్రదర్శిస్తోంది

పరిచయం

యామ్స్, ( డయోసెరియా spp), తూర్పు ఆఫ్రికాలో సాగు చేసే అత్యంత ముఖ్యమైన జీవనాధార పంటలలో ఒకటి, ఇది వార్షిక ఉష్ణమండల గడ్డ దినుసు పంట, ఇది 25-30% శక్తితో గడ్డ దినుసును కలిగి ఉంటుంది. అందువల్ల నిర్లక్ష్యం చేయబడిన తూర్పు ఆఫ్రికాలో పండించే అత్యంత ముఖ్యమైన జీవనాధార పంటలలో యమ్స్ ఒకటి.

అనేక రకాల ఇన్ఫెక్షన్‌ల రూపంలో తరచుగా సంభవించే వైరల్ వ్యాధులు, యమ్‌ల ఉత్పత్తికి ప్రధాన అడ్డంకిగా ఉంటాయి మరియు మొక్కల పెరుగుదలకు, ఆకులను తగ్గించడానికి, గడ్డ దినుసుల శక్తి తగ్గడానికి మరియు వ్యక్తిగత మొక్కలలో, 93% వరకు దిగుబడి నష్టాలకు కారణమవుతుంది. 140 వైరస్ జాతుల సభ్యులు సహజంగా లేదా కృత్రిమంగా యామ్‌లను సోకవచ్చు, వీటిలో పన్నెండు జాతులు మాత్రమే ఆఫ్రికాలో ఇప్పటివరకు కనుగొనబడ్డాయి, వీటిలో మూడు మాత్రమే E. ఆఫ్రికన్ నుండి నివేదించబడ్డాయి. ఈ పన్నెండు జాతులలో ఎనిమిది జాతులలోని వైరస్‌లు వాటి ప్రభావవంతమైన నియంత్రణను తీవ్రంగా దెబ్బతీసే అంశం. ఉదాహరణకు, విత్తన ప్రసారం YVకి 2%, వైరస్ కోసం 6.9%-యమ్ మొజాయిక్ వైరస్ (YMV), మరియు దోసకాయ మొజాయిక్ వైరస్ (cMV; 13.3%)కి చేరుకుంటుంది. యామ్స్-ఇన్ఫెక్షన్ వైరస్‌లలో చాలా విస్తృతమైన వైవిధ్యం ఉంది. ఆఫ్రికాలో మరెక్కడైనా కనుగొనబడినప్పటికీ, కెన్యాలో అదనపు యామ్స్-ఇన్ఫెక్షన్ వైరస్లు కనుగొనబడే అవకాశం ఉంది ఈ దేశంలో యముడు సోకే వైరస్‌లపై అందుబాటులో ఉన్న పరిమిత జ్ఞానం వ్యాధుల నియంత్రణకు ఆటంకం కలిగిస్తుంది, ముఖ్యంగా వ్యాధి-రహిత విత్తనాల ఉత్పత్తికి సంబంధించి మరియు వైరస్-నిరోధక యమ రకాలను రూపొందించడానికి, ఈ అధ్యయనం యొక్క ప్రధాన లక్ష్యం మరింత పరిశోధించడం HTS మరియు POX మార్కర్‌లను ఉపయోగించడం ద్వారా కెన్యాలో కొత్త వైరస్‌ల వైవిధ్యం.

సమస్య ప్రకటన

కెన్యాలో సాగులో ఉన్న డయోస్కోరియా జాతుల ప్రశ్న ఈ అధ్యయనానికి ఆధారం. ఈ అధ్యయనం DNA మరియు RNA న్యూక్లియోటైడ్ సీక్వెన్స్‌లను ఉపయోగించి మాలిక్యులర్ ఫైలోజెని ద్వారా దీనిని పరిష్కరించే లక్ష్యంతో వాటిని తెలిసిన ఆఫ్రికన్ జాతులు మరియు జన్యు బ్యాంకులోని సమాచారంతో జాతులకు సంబంధించినది. ఈ అధ్యయనం యమ్‌లలో కొత్తగా వైరస్‌ను లక్ష్యంగా చేసుకుంది, ఇది యమ్‌ల యొక్క జీవక్రియ ప్రతిచర్యకు ఆటంకం కలిగిస్తుంది, తత్ఫలితంగా డయోస్కోరిన్ స్థాయిని తగ్గిస్తుంది, ఇది చాలా ప్రోటీన్‌ను కలిగి ఉంటుంది, ఇది యమ్‌ల పోషక విలువను జోడిస్తుంది.

సమర్థన

డయోస్కోరియా ఆహారం కోసం మరియు దాని ఔషధ సామర్థ్యం కారణంగా ముఖ్యమైన పంట. కెన్యాలో మరియు ప్రపంచవ్యాప్తంగా డయోస్కోరియా వర్గీకరణ అనేది పదనిర్మాణ లక్షణాల ఆధారంగా వర్గీకరణ శాస్త్రవేత్తలకు చాలా సవాలుగా ఉంది. డయోస్కోరియా జాతుల వర్గీకరణలో కష్టానికి అనేక కారణాలు ముడిపడి ఉన్నాయి . మొదటిది, డయోస్కోరియా వర్గీకరణ అనేది ఒక జాతిలోని వర్గీకరణ స్వభావం యొక్క సంక్లిష్టత మరియు ప్లాస్టిసిటీ కారణంగా సవాలుగా ఉంది, అందువల్ల వాటిని గుర్తించడంలో ఇబ్బంది మరియు పర్యావరణ మార్పుల కారణంగా వైరస్ వైరస్ మరియు యమ్‌లలో మ్యుటేషన్‌ను తీసుకువచ్చింది. రెండవది, డయోస్కోరియా ప్రపంచవ్యాప్తంగా పరిశోధకులచే నిర్లక్ష్యం చేయబడిన పంట. సంతానోత్పత్తి ప్రయోజనాల కోసం జాతుల స్పష్టమైన భేదం చాలా ముఖ్యమైనది. ఇచ్చిన జీవి యొక్క మ్యాపింగ్ జాతులు పరిరక్షణ ప్రయోజనాల కోసం మాత్రమే కాకుండా సంతానోత్పత్తి ప్రయోజనాల కోసం కూడా అవసరం. హై-త్రూపుట్ సీక్వెన్సింగ్ మరియు పాక్స్ మార్కర్లను ఉపయోగించడం ద్వారా డయోస్కోరియాలోని పదనిర్మాణపరంగా సంక్లిష్టమైన టాక్సాలో వైరస్ జాతులను ఉంచడానికి మాలిక్యులర్ ఫైలోజెనిని ఉపయోగించవచ్చు , వైరస్ సంభావ్యంగా ఉంటుంది మరియు యమ్‌ల జన్యు కూర్పుపై ప్రభావం చూపుతుంది కాబట్టి యామ్‌ల ఉత్పాదకతను తగ్గిస్తుంది.