ISSN: 2476-2059
Bassirou Ndoye, Xianqin Yang, Le Luo Guan, Khalifa Ababacar Sylla, Mamoudou H. Dicko, Ibrahima Ndoye, Alfred S. Traore, Amadou Tidiane Guiro, Colin O. Gill
మైక్రోఫ్లోరా యొక్క వైవిధ్యం కెనడాలోని ఒక పెద్ద మాంసం ప్యాకింగ్ ప్లాంట్లో పాశ్చరైజ్డ్ మాంసం మృతదేహాలపై నిర్మూలన చికిత్సల ప్రభావాన్ని అంచనా వేయడానికి నిర్ణయించబడింది. పాశ్చరైజ్డ్ మాంసం మృతదేహాల చికిత్స చేయని నమూనాలపై వేడి-చికిత్స మరియు DNase-I- చికిత్స చేసిన నమూనాలలో జీవించి ఉన్న బ్యాక్టీరియా వైవిధ్యాన్ని వర్గీకరించడం ప్రధాన లక్ష్యాలు. ప్రతి నమూనాలో తక్కువ సంఖ్యలో బ్యాక్టీరియా మనుగడను లెక్కించడానికి సాగు ఆధారిత-పద్ధతులు సమూహ PCR-DGGE వేలిముద్ర పద్ధతులతో మిళితం చేయబడ్డాయి. DGGE రిఫరెన్స్ మార్కర్ని ఉపయోగించి, DGGE మరియు సాగు-ఆధారిత పద్ధతి రెండింటి ద్వారా ఏడు జాతులు ( సూడోమోనాస్, స్టెఫిలోకాకస్, ప్రొపియోనిబాక్టీరియం, క్రిసోబాక్టీరియం, ఫ్లావోబాక్టీరియం, రాల్స్టోనియా, పెనిబాసిల్లస్ ) కనుగొనబడ్డాయి. మూడు జాతులు ( స్ట్రెప్టోకోకస్ సాలివేరియస్, మైక్రోకాకస్ లూటియస్ మరియు ల్యూకోనోస్టోక్ మెసెంటెరాయిడ్స్ ) సాగు-ఆధారిత పద్ధతితో స్వచ్ఛమైన సంస్కృతులలో ప్రత్యేకంగా కనుగొనబడ్డాయి. వాస్తవ నమూనాలలో DGGE మార్కర్ జాతులు మరియు బ్యాండ్లు రెండింటినీ ఉపయోగించి PCR-DGGE ద్వారా పదిహేను కంటే ఎక్కువ జాతులు కనుగొనబడ్డాయి, ఇది ఈ సాంకేతికత ద్వారా నిర్ణయించబడిన అత్యధిక వైవిధ్యాన్ని సూచిస్తుంది. దీనికి విరుద్ధంగా, సాగు-ఆధారిత పద్ధతి ద్వారా అత్యధిక పరిమాణంలో జాతులు కనుగొనబడ్డాయి (29 మరియు 88 వేడి 34 చికిత్స మరియు చికిత్స చేయని నమూనాలు వరుసగా). Enterobacteriaceae కుటుంబంలో ఐదు E. కోలి ఐసోలేట్లు చికిత్స చేయని నమూనాలలో ప్లేటింగ్ పద్ధతులతో కనుగొనబడ్డాయి, ఇది మాంసం నమూనాలను శుభ్రపరచడం మరియు వేడి చికిత్సలతో ప్రాసెస్ చేయడం యొక్క ఉపయోగాన్ని ప్రదర్శిస్తుంది. అయినప్పటికీ, సాగు-ఆధారితంగా గుర్తించలేని జాతులు లేదా జాతులు చాలా వరకు PCR-DGGE ద్వారా కనుగొనబడ్డాయి, ఆహార నమూనాలలో బ్యాక్టీరియాను పూర్తిగా ప్రొఫైల్ చేయడానికి సంస్కృతి-ఆధారిత మరియు స్వతంత్ర పద్ధతులు రెండింటినీ కలపడం యొక్క ప్రభావాన్ని నిర్ధారిస్తుంది.