బయాలజీ & మెడిసిన్లో అధునాతన సాంకేతికతలు
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

డబుల్ β-అలనైన్ ప్రత్యామ్నాయాలు 12-రింగ్ పైరోల్-ఇమిడాజోల్ పాలిమైడ్స్‌లో పొడవాటి DNA మైనర్ గ్రూవ్ గుర్తింపు కోసం చేర్చబడ్డాయి

తకయోషి వటనాబే, కెన్-ఇచి షినోహరా, యోషినావో షినోజాకి, స్యోటా ఉకుసా, జియోఫీ వాంగ్, నోబుకో కోషికావా, కిరికో హిరోకా, తకహిరో ఇనౌ, జాసన్ లిన్, తోషికాజు బాండో , హిరోషి సుగియామా మరియు హిరోకీ నగసే

N-methylpyrrole (Py)-N-methylimidazole (Im) పాలిమైడ్ (PI పాలిమైడ్) ప్రాథమిక మరియు అనువర్తిత బయోమెడికల్ పరిశోధనలో ఎక్కువగా ఉపయోగించబడుతుంది. 8-రింగ్ PI పాలిమైడ్‌లలోని β-అలనైన్ (β) ప్రత్యామ్నాయాలు బాగా విశ్లేషించబడినప్పటికీ, పొడిగించిన DNA మైనర్ గ్రూవ్ గుర్తింపు కోసం డబుల్ β ప్రత్యామ్నాయాల సమర్థత వివోలో స్పష్టంగా చెప్పబడలేదు. ఇక్కడ, నిర్దిష్ట పొడవైన DNA బైండింగ్ యొక్క అధిక అనుబంధాన్ని నిలుపుకోవడానికి మరియు కణాలలో లక్ష్య జన్యు వ్యక్తీకరణను అణిచివేసేందుకు PI పాలిమైడ్‌లలో డబుల్ β ప్రత్యామ్నాయాల ప్రభావాన్ని మేము చూపుతాము. ప్రారంభంలో మేము MMP-9 జన్యు ప్రమోటర్‌లోని AP-1 సైట్‌ను లక్ష్యంగా చేసుకుని నాలుగు 12-రింగ్ PI పాలిమైడ్‌లను సంశ్లేషణ చేసాము, 1-4, ఇందులో β/β జత (3) మరియు రెండు ప్రక్కనే ఉన్న Py/β మరియు β/Im జతల (4) మరియు ఉపరితలం ద్వారా ప్రాధాన్య క్రమాన్ని (5'-AGTCAGCA-3') కలిగి ఉన్న ఒలిగోడిఎన్‌ఎతో బైండింగ్ గతిశాస్త్రాన్ని పరిశోధించారు MDA-MB-231 కణాలలో ప్లాస్మోన్ రెసొనెన్స్ అస్సేస్ మరియు MMP-9 mRNA వ్యక్తీకరణ. PI పాలిమైడ్లు 3 మరియు 4 లక్ష్య DNA బైండింగ్ (KD=4.33×10-8) మరియు (KD=5.00×10-8) యొక్క అధిక అనుబంధాలను వరుసగా మరియు MMP-9 వ్యక్తీకరణ యొక్క ముఖ్యమైన నియంత్రణను చూపించాయి. మేము ప్రక్కనే ఉన్న Im/β మరియు β/Im జంటలు GC క్రమాన్ని పునరావృతం చేసే సమస్యను పరిష్కరించాలని భావించాము. MYCN ప్రమోటర్‌లోని E2F సైట్, 5'-TTGGCGC-3ని లక్ష్యంగా చేసుకున్న PI పాలిమైడ్ 5 సంశ్లేషణ చేయబడింది మరియు MYCN యాంప్లిఫైడ్ CHP134 హ్యూమన్ న్యూరోబ్లాస్టోమా కణాలలో బైండింగ్ అనుబంధం మరియు MYCN అణచివేతను పరీక్షించింది. PI పాలిమైడ్ 5 లక్ష్య శ్రేణి యొక్క అధిక అనుబంధాన్ని (KD=3.07×10-8) చూపింది మరియు MYCN mRNA వ్యక్తీకరణను గణనీయంగా అణిచివేసింది. ఆ ఫలితాలు 12-రింగ్ PI పాలిమైడ్‌ల కోసం ప్రక్కనే ఉన్న డబుల్ β ప్రత్యామ్నాయాల యొక్క సాధ్యమైన ఉపయోగాన్ని ప్రదర్శించాయి, ముఖ్యంగా G/C రిచ్ ప్రాంతాలలో మరియు PI పాలిమైడ్‌లలో β స్ప్రింగ్‌ల ప్రత్యామ్నాయాలు పొడవైన జన్యుసంబంధమైన DNAని లక్ష్యంగా చేసుకుని vivo బయోమెడికల్ పరిశోధనలో అప్లికేషన్‌లను విస్తరించవచ్చని సూచించింది.