ట్రాన్స్క్రిప్టోమిక్స్: ఓపెన్ యాక్సెస్
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

క్లివియా మినియాటాలో చాల్కోన్ సింథేస్ (CHS) మరియు ఆంథోసైనిడిన్ సింథేస్ (ANS) జన్యువుల లక్షణం మరియు వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణలు

అచిలోను సి కాన్రాడ్ మరియు మలేక ఎఫ్ మఠబాత

మొక్కలలో ఆంథోసైనిన్‌ల ఉత్పత్తికి కారణమయ్యే కీలక ఎంజైమ్‌లలో చాల్కోన్ సింథేస్ (CHS) మరియు ఆంథోసైనిడిన్ సింథేస్ (ANS) ఉన్నాయి. అవి సాధారణంగా బహుళ-జన్యు కుటుంబాలచే ఎన్కోడ్ చేయబడతాయి, ఈ కుటుంబాలలోని కొంతమంది సభ్యులు రంగు పిగ్మెంటేషన్‌కు దోహదం చేస్తారు. అధ్యయనం Clivia miniataలో CHS మరియు ANS జన్యువులను పరిశీలించింది; దీని పుష్పించే కణజాలం రంగు మార్పులకు లోనవుతుంది. RNA నుండి cDNA వరకు పుష్ప కణజాలాల నుండి వేరుచేయబడింది మరియు మూడు యూనిజీన్(లు) (CmiCHS 11996, CmiCHS 43839 మరియు CmiANS) చిన్న శ్రేణి పొడవులను మొదట్లో తదుపరి తరం సీక్వెన్సింగ్ పద్ధతిని ఉపయోగించి పొందారు. జన్యు-నిర్దిష్ట ప్రైమర్‌లు CHS మరియు ANS యొక్క ప్రచురించబడని ప్రారంభ షార్ట్ సీక్వెన్స్‌ల నుండి రూపొందించబడ్డాయి. PCR తర్వాత విస్తరించిన cDNA పొడవు CmiCHS 11996 (933 bp), CmiCHS 43839 (951 bp) మరియు CmiANS (983 bp). CHS జన్యువుల కోసం 390 అమైనో యాసిడ్ డిడ్యూస్డ్ ప్రొటీన్ (AEN04070) యొక్క ఊహించిన ప్రొటీన్‌కు అనుగుణంగా ORF ఫ్రేమ్‌ను ప్రారంభంలో అనువదించారు మరియు ANS జన్యువు (AGD99672)కి సంబంధించి 355 అమైనో ఆమ్లాలను అంచనా వేసింది. సిలికో విశ్లేషణలో లెక్కించిన మాలిక్యులర్ బరువు మరియు సైద్ధాంతిక ఐసోఎలెక్ట్రిక్ పాయింట్ (pI) CmiCHS 11996 మరియు CmiCHS43839 వరుసగా 31.0 kDa - 6.95 మరియు 34.6 kDa - 7.54. ఉత్పత్తి బైండింగ్ సైట్ మరియు క్రియాశీల సైట్ యొక్క ముఖ్యమైన మూలాంశాలు తగ్గించబడిన అమైనో ఆమ్ల శ్రేణుల నుండి విజయవంతంగా గుర్తించబడ్డాయి. బహుళ శ్రేణి అమరిక CmiCHS మరియు CmiANS సీక్వెన్సులు బాగా సంరక్షించబడిందని మరియు ఇతర మొక్కల నుండి చాల్కోన్ సింథేజ్‌లతో అధిక శ్రేణి గుర్తింపును (> 83%) పంచుకున్నాయని చూపించింది. అయినప్పటికీ, నిజ-సమయ పరిమాణాత్మక PCRని ఉపయోగించి వివిధ కణజాలాలలో అలాగే టెపల్స్ (నారింజ మరియు పసుపు పువ్వు)లో ఈ జన్యువుల వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్‌లను నిర్ణయించడానికి మరొక పరీక్ష జరిగింది. ఇతర కణజాలాలతో (ఆకులు, శైలి మరియు కళంకం మరియు స్కేప్) పోలిస్తే CmiCHS మరియు CmiANS యొక్క వ్యక్తీకరణ స్థాయిలు టెపల్స్‌లో ఎక్కువగా ఉన్నాయి. కణజాలంలోని జన్యువుల యొక్క ఈ వ్యక్తీకరణ నమూనాలు ఆంథోసైనిన్ పేరుకుపోవడానికి అనుగుణంగా ఉంటాయి, నారింజ మరియు పసుపు రంగు వర్ణద్రవ్యాలు ఖచ్చితంగా చాల్కోన్ సింథేస్ మరియు ఆంథోసైనిన్ సింథేస్ నియంత్రణకు సంబంధించినవని సూచిస్తున్నాయి.