ISSN: 2155-9570
అమీనా మామా బౌబ్క్యూర్, లోట్ఫీ లౌహిబీ, మెరీమ్ అబ్ది, ఫాతిమా జోహ్రా మోగ్టిట్, నసెరా తాబెట్ ఔల్, రిమ్ అబ్దెరహ్మనే, ఖదీజా మహమూదీ, మెరిమ్ అబెర్కనే మరియు నాధీరా సైదీ-మెహతర్
రెటినోబ్లాస్టోమా అనేది రెటినోబ్లాస్టోమా జన్యువు ( RB1 ) యొక్క బియాలిలిక్ ఇనాక్టివేషన్ ద్వారా ప్రారంభించబడిన పిల్లల రెటీనా కణితి. చాలా మార్పులు ప్రత్యేకమైనవి మరియు యాదృచ్ఛికంగా మొత్తం కోడింగ్ ప్రాంతం అంతటా పంపిణీ చేయబడ్డాయి. ఈ అధ్యయనం మొదటగా రాజ్యాంగ స్థాయి మంత్రగత్తెలో RB1 జన్యువును ప్రభావితం చేసే ఉత్పరివర్తనాలను గుర్తించడం లక్ష్యంగా పెట్టుకుంది, ఈ వ్యాధి యొక్క పరమాణు వ్యాధికారకతను అర్థం చేసుకోవడానికి మరియు ప్రమాదంలో ఉన్న విషయాన్ని మరియు లక్షణరహిత క్యారియర్లను ముందస్తుగా గుర్తించడానికి దోహదం చేస్తుంది. 30 మంది రోగి యొక్క DNAలలో వైవిధ్యాలను గుర్తించడం అధిక పనితీరు గల లిక్విడ్ క్రోమాటోగ్రఫీ (HPLC) ద్వారా నిర్వహించబడింది, తరువాత సీక్వెన్సింగ్ చేయబడింది. రెండవది, మేము విశ్లేషణాత్మక పద్ధతులు (అలైన్ GVGD, మ్యుటేషన్ టేస్టింగ్, SIFT, PolyPhen, I-Mutant మరియు KD4V) మరియు స్ట్రక్చరల్ (స్విస్-పిడిబి వ్యూయర్) ఆధారంగా విభిన్న సాఫ్ట్వేర్లను ఉపయోగించి సిలికో విశ్లేషణలో ప్రోటోకాల్ను అభివృద్ధి చేసాము . ప్రోటీన్ pRbపై ఉత్పరివర్తనాల యొక్క హానికరమైన ప్రభావాలను అంచనా వేయడానికి ఈ ప్రోటోకాల్ ఉపయోగించబడింది. మ్యుటేషన్ స్పెక్ట్రమ్లో 2 మిస్సెన్స్ మ్యుటేషన్లు, 1 నాన్సెన్స్ మ్యుటేషన్, 1 డిలీషన్, 1 మ్యుటేషన్ ప్రభావితం స్ప్లైస్ సైట్ మరియు 2 పాలిమార్ఫిజమ్లు ఉన్నాయి. ఈ ఉత్పరివర్తనాలలో, వ్యాధి యొక్క కుటుంబ చరిత్ర లేని పిల్లల కోసం కొన్ని జెర్మినల్ స్థాయిలో గుర్తించబడ్డాయి. అందువల్ల, సిలికో విశ్లేషణలో కేవలం మూడు కారణ ఉత్పరివర్తనలు మాత్రమే గుర్తించబడ్డాయి, స్ప్లైస్ డోనర్ సైట్లోని మొదటి ఇంట్రానిక్ మ్యుటేషన్ బహుశా ఫ్రేమ్ మార్పుకు కారణమైంది, ఇది కత్తిరించబడిన ప్రోటీన్కు దారితీస్తుంది. రెండవ మిస్సెన్స్ మ్యుటేషన్ c.1903 G˃C స్ప్లికింగ్ ప్రక్రియలను ప్రభావితం చేస్తుందని అంచనా వేయబడింది. ఎక్సాన్ 20లో ఉన్న మూడవ మ్యుటేషన్ c.1961T>A ప్రోటీన్ పనితీరు మరియు నిర్మాణానికి అంతరాయం కలిగించవచ్చు.
ఈ అధ్యయనంలో, సిలికో విశ్లేషణలో ప్రోటీన్ యొక్క నిర్మాణం మరియు పనితీరుపై ఉత్పరివర్తనాల ప్రభావం చూపబడింది. ఉత్పరివర్తనాల కార్యాచరణను అంచనా వేయడానికి ఈ ఫలితాలను ఇతర ఫంక్షనల్ అధ్యయనాలతో పోల్చడం ఆసక్తికరంగా ఉంటుంది.