గ్లోబల్ జర్నల్ ఆఫ్ లైఫ్ సైన్సెస్ అండ్ బయోలాజికల్ రీసెర్చ్
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

మానవులలో Tp53 జన్యువు యొక్క ఫైలోజెనెటిక్స్ విశ్లేషణ మరియు రొమ్ము క్యాన్సర్ నిర్ధారణ కోసం బయోసెన్సర్‌లలో దాని ఉపయోగం

సారా డా సిల్వా నాస్సిమెంటో, పియరీ టెయోడోసియో ఫెలిక్స్*

బయోసెన్సర్‌లు లక్ష్య విశ్లేషణలను గుర్తించడానికి జీవసంబంధ ప్రతిచర్యలను ఉపయోగించే చిన్న పరికరాలు. ఇటువంటి పరికరాలు భౌతిక ట్రాన్స్‌డ్యూసర్‌తో జీవసంబంధమైన
భాగాన్ని మిళితం చేస్తాయి, ఇది బయో-రికగ్నిషన్ ప్రక్రియలను కొలవగల సంకేతాలుగా మారుస్తుంది. దీని ఉపయోగం
అనేక ప్రయోజనాలను తెస్తుంది, ఎందుకంటే అవి అత్యంత సున్నితమైనవి మరియు ఎంపిక చేయబడినవి, అభివృద్ధి పరంగా సాపేక్షంగా సులభం,
అలాగే ప్రాప్యత మరియు ఉపయోగించడానికి సిద్ధంగా ఉన్నాయి. కణ గ్రాహకాలు మరియు ప్రతిరోధకాలు లేదా పరోక్ష గుర్తింపు వంటి ఉత్ప్రేరక రహిత లిగాండ్‌ని ఉపయోగించి బయోసెన్సర్‌లు ప్రత్యక్షంగా గుర్తించబడతాయి
, ఇందులో ఫ్లోరోసెంట్‌గా గుర్తించబడిన ప్రతిరోధకాలు
లేదా ఎంజైమ్‌ల వంటి ఉత్ప్రేరక మూలకాల ఉపయోగం ఉంటుంది. అవి బయో-అఫినిటీ పరికరాలుగా కూడా కనిపిస్తాయి,
ఉపరితలానికి జోడించబడిన లిగేటివ్‌కు లక్ష్య విశ్లేషణ యొక్క ఎంపిక బంధంపై మాత్రమే ఆధారపడి ఉంటాయి (ఉదా, ఒలిగోన్యూక్లియోటైడ్ ప్రోబ్).
పరమాణు డేటాబేస్‌లలో నిక్షిప్తం చేయబడిన TP53 జన్యువు యొక్క శకలాలు ఉన్న జన్యు వైవిధ్య స్థాయిలను అంచనా వేయడం
మరియు రొమ్ము క్యాన్సర్‌ను గుర్తించడంలో బయోసెన్సర్‌గా దాని సాధ్యతను అధ్యయనం చేయడం లక్ష్యాలు .
GENBANK నుండి మానవుల యొక్క TP53 జన్యువు యొక్క 301 సీక్వెన్స్‌లను పునరుద్ధరించడం మరియు విశ్లేషించడం అనేది ఉపయోగించిన పద్దతి , ఇది
MEGA సాఫ్ట్‌వేర్ వెర్షన్ 6.06తో సమలేఖనం చేయబడిన తర్వాత, TREE-PUZZLE 5.2ని ఉపయోగించి ఫైలోజెనెటిక్ సిగ్నల్ కోసం పరీక్షించబడింది. PAUP వెర్షన్ 4.0b10 ద్వారా గరిష్ట సంభావ్యత కలిగిన వృక్షాలు
ఉత్పత్తి చేయబడ్డాయి మరియు శాఖల స్థిరత్వం
1000 నకిలీ-ప్రతిరూపాలతో బూట్‌స్ట్రాప్ పరీక్షతో ధృవీకరించబడింది. సమలేఖనం చేసిన తర్వాత, 791 సైట్‌లలో 783 సంరక్షించబడ్డాయి. (0.90 0.96, 1.00, 1.04 మరియు 1.10 ప్రతి సైట్‌కి ప్రత్యామ్నాయాలు) ఉన్న సైట్‌ల మధ్య పరిణామ రేట్ల
కోసం గామా పంపిణీ 05 కేటగిరీలు + G ఉపయోగించినందున గరిష్ట సంభావ్యత స్వల్పంగా వ్యక్తీకరించబడింది .
ML విలువలను అంచనా వేయడానికి,
ఈ గణన కోసం గరిష్టంగా -1058,195 లాగ్‌తో ట్రీ టోపోలాజీ స్వయంచాలకంగా గణించబడుతుంది. తప్పిపోయిన ఖాళీలు లేదా డేటాను కలిగి ఉన్న అన్ని స్థానాలు
తొలగించబడ్డాయి, తుది డేటాసెట్‌లో మొత్తం 755 సైట్‌లు మిగిలి ఉన్నాయి. పరిణామ
చరిత్రను 500 ప్రతిరూపాల ద్వారా సృష్టించబడిన ఏకాభిప్రాయ వృక్షాలు సూచిస్తాయి, ఇది పొరుగు-చేరడం మరియు BioNJ అల్గారిథమ్‌ల ప్రకారం హాప్లోటైప్‌ల మధ్య కనిష్ట దూరాలతో మాతృకను ఏర్పాటు చేసింది, ఇది TP53 జన్యువు కోసం
అధిక స్థాయి పరిరక్షణను ధృవీకరిస్తుంది . మానవ జనాభాలో రొమ్ము క్యాన్సర్ నిర్ధారణ
కోసం బయోసెన్సర్‌ల నిర్మాణంలో GENE TP53 బలమైన అభ్యర్థిగా కనిపిస్తోంది .