కీమోథెరపీ: ఓపెన్ యాక్సెస్
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

పాన్-క్యాన్సర్ విశ్లేషణ SEC11Aని రోగనిరోధక మరియు ప్రోగ్నోస్టిక్ బయోమార్కర్‌గా గుర్తిస్తుంది

క్వింగ్కింగ్ వు, చెంగ్‌డాంగ్ లియు, గ్వాంగ్‌జావో హువాంగ్, జిన్యాన్ లు, జియావోజీ ఎల్వి, టింగ్రు షావో

లక్ష్యం: కార్సినోజెనిసిస్‌లో SEC11A కోసం పరిమిత సాక్ష్యం కీలక పాత్రను సూచిస్తుంది. మా అధ్యయనం బహుళ-ఓమిక్స్ డేటా ఆధారంగా పాన్-క్యాన్సర్‌లో SEC11A యొక్క పరమాణు లక్షణాలు మరియు క్లినికల్ ఔచిత్యంపై సమగ్ర విశ్లేషణను నిర్వహించింది.

మెటీరియల్స్ మరియు పద్ధతులు: SEC11A వ్యక్తీకరణ 33 రకాల కణితి మరియు సాధారణ నమూనాలను ఉపయోగించి ది క్యాన్సర్ జీనోమ్ అట్లాస్-జెనోటైప్-టిష్యూ ఎక్స్‌ప్రెషన్ (TCGA-GTEx) ప్రాజెక్ట్ మరియు క్లినికల్ ప్రోటీమిక్ ట్యూమర్ అనాలిసిస్ ప్రాజెక్ట్ (ACCPTACT కాన్సోర్టియం) నుండి ప్రోట్రోమిక్ డేటా నుండి ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ ప్రొఫైల్‌లను ఉపయోగించి విశ్లేషించబడింది. CBioPortalతో పాన్-క్యాన్సర్‌లో SEC11A యొక్క కాపీ సంఖ్య మార్పులు మరియు మిథైలేషన్ పరిశోధించబడ్డాయి. SEC11A యొక్క క్లినికల్ ఔచిత్యం మరియు ప్రోగ్నోస్టిక్ చిక్కులు ది క్యాన్సర్ జీనోమ్ అట్లాస్ (TCGA) కోహోర్ట్‌లలో మూల్యాంకనం చేయబడ్డాయి. SEC11A యొక్క జీన్ సెట్ ఎన్‌రిచ్‌మెంట్ అనాలిసిస్ (GSEA) క్లస్టర్ ప్రొఫైలర్ ప్యాకేజీతో హెడ్ అండ్ నెక్ స్క్వామస్ సెల్ కార్సినోమా (HNSCC)లో నిర్వహించబడింది. రోగనిరోధక కణాల చొరబాట్లతో SEC11A యొక్క సహసంబంధం రోగనిరోధక మరియు క్యాన్సర్ కణాల నిష్పత్తులను అంచనా వేయడం (EPIC), ట్యూమర్ ఇమ్యూన్ ఎస్టిమేషన్ రిసోర్స్ (TIMER), xCELL, మైక్రో ఎన్విరాన్‌మెంట్ సెల్ పాపులేషన్స్-కౌంటర్ (MCP-కౌంటర్), పరిమాణీకరణ, సెల్ టైప్‌ల ఆధారంగా అంచనా వేయబడింది. RNA ట్రాన్స్క్రిప్ట్స్ యొక్క సాపేక్ష ఉపసమితులు (CIBERSORT) మరియు ఇమ్యూన్ సెల్ అబండెన్స్ ఐడెంటిఫైయర్ (ImmuCellAI) అల్గారిథమ్‌లు. క్యాన్సర్ (GDSC) ప్రాజెక్ట్‌లో జెనోమిక్స్ ఆఫ్ డ్రగ్ సెన్సిటివిటీ నుండి యాంటీ-క్యాన్సర్ ఏజెంట్ల యొక్క ఇన్హిబిటరీ ఏకాగ్రత (IC ₅₀ ) విలువలు సేకరించబడ్డాయి మరియు SEC11Aకి వాటి సహసంబంధాలు లెక్కించబడ్డాయి.

ఫలితాలు: SEC11A యొక్క వ్యక్తీకరణ చాలా క్యాన్సర్ రకాల్లో (24/33) నియంత్రించబడిందని మేము కనుగొన్నాము, అయితే 3 రకాల క్యాన్సర్‌లలో నియంత్రించబడలేదు. SEC11Aలో జన్యు విస్తరణ పాన్-క్యాన్సర్‌లో విస్తృతంగా వ్యాపించింది. మిథైలేషన్ స్థాయితో SEC11A రిబోన్యూక్లిక్ యాసిడ్ (RNA) వ్యక్తీకరణకు ప్రతికూల సహసంబంధాలు ఉన్నాయి. SEC11A యొక్క అధిక నియంత్రణ అడ్రినోకోర్టికల్ కార్సినోమా మరియు HNSCC లలో అననుకూల రోగ నిరూపణను సూచించింది. అంతేకాకుండా, SEC11A సెల్ సైకిల్, TP53 నియంత్రణ మరియు యాంటిజెన్ ప్రాసెసింగ్‌లో సన్నిహితంగా పాల్గొంది. SEC11A కణితి-సంబంధిత మాక్రోఫేజ్ మరియు ఫైబ్రోబ్లాస్ట్‌తో సానుకూలంగా అనుబంధించబడింది కానీ CD8 ⁺ T సెల్‌తో ప్రతికూలంగా అనుబంధించబడింది. SEC11A యొక్క వ్యక్తీకరణ యాంటీకాన్సర్ ఔషధాలకు ఔషధ నిరోధకతకు సానుకూలంగా సంబంధం కలిగి ఉంది.

తీర్మానం: ఈ పరిశోధనలు SEC11A పాన్-క్యాన్సర్ అంతటా ప్రోగ్నోస్టిక్ బయోమార్కర్‌గా పనిచేస్తుందని సూచించింది. కణితి రోగనిరోధక శక్తిని తగ్గించే స్థితికి సంబంధించి SEC11A యొక్క అధిక నియంత్రణ. సమిష్టిగా, మా ఫలితాలు క్యాన్సర్‌లలో SEC11A యొక్క యాంత్రిక మరియు చికిత్సా విశ్లేషణకు మార్గనిర్దేశం చేసే విలువైన వనరును అందించాయి.