ఇమ్యునోజెనెటిక్స్: ఓపెన్ యాక్సెస్

ఇమ్యునోజెనెటిక్స్: ఓపెన్ యాక్సెస్
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

రీసస్ మకాక్ ఎక్సోమ్ సీక్వెన్సెస్ నుండి MHC జెనోటైపింగ్

జాన్ ఆర్ కాస్కీ, రోజర్ డబ్ల్యు వైజ్‌మన్, జూలీ ఎ కార్ల్, డేవిడ్ ఎ బేకర్, టేలర్ లీ, రాబర్ట్ జె మాడాక్స్, ముత్తుస్వామి రవీంద్రన్, ఆర్ అలాన్ హారిస్, జియాన్‌హాంగ్ హు, డోనా ఎం ముజ్నీ, జెఫ్రీ రోజర్స్ మరియు డేవిడ్ హెచ్ ఓ'కానర్

ఇండియన్ రీసస్ మకాక్ మేజర్ హిస్టోకాంపాబిలిటీ కాంప్లెక్స్ (MHC)-వైవిధ్యం మార్పిడి మరియు అంటు వ్యాధి అధ్యయనాల ఫలితాలను ప్రభావితం చేస్తుంది. తరచుగా, ఊహించని ఫలితాలకు కారణమయ్యే వేరియంట్‌లను గుర్తించడానికి రీసస్ మకాక్‌లు MHC జన్యురూపం కలిగి ఉంటాయి. వైవిధ్యం ప్రయోగాత్మక ఫలితాలను ప్రభావితం చేసే జన్యువులో MHC ఒక ప్రాంతం మాత్రమే కాబట్టి, మకాక్ MHC మరియు ప్రోటీన్ కోడింగ్ జీనోమ్‌లోని శేషంలోని వైవిధ్యాన్ని ఏకకాలంలో ప్రొఫైలింగ్ చేసే వ్యూహాలు ఉపయోగకరంగా ఉంటాయి. ఇక్కడ మేము MHC సీక్వెన్స్‌ల కోసం సుసంపన్నమైన టార్గెట్-క్యాప్చర్ ప్రోబ్‌లను ఉపయోగించి MHC క్లాస్ I మరియు క్లాస్ II జన్యురూపాలను నిర్ణయిస్తాము, ఈ పద్ధతిని మేము మకాక్ ఎక్సోమ్ సీక్వెన్స్ (MES) జెనోటైపింగ్ అని పిలుస్తాము. 27 భారతీయ రీసస్ మకాక్‌ల సమిష్టి కోసం, మేము MES డేటా నుండి MHC జన్యురూపాలను పొందడం కోసం రెండు పద్ధతులను వివరిస్తాము మరియు ఈ పద్ధతులతో పొందిన MHC క్లాస్ I మరియు క్లాస్ II జన్యురూప ఫలితాలు వరుసగా 98.1% మరియు 98.7% అంచనాతో MHC జన్యురూపాలతో పొందవచ్చని నిరూపిస్తాము. . దీనికి విరుద్ధంగా, షార్ట్ మల్టీప్లెక్స్ PCR యాంప్లికాన్‌ల డీప్ సీక్వెన్సింగ్ ద్వారా పొందిన సాంప్రదాయ MHC జెనోటైపింగ్ ఫలితాలు ఈ సమిష్టి అంచనాలతో కేవలం 92.6% ఏకీభవించాయి.

నిరాకరణ: ఈ సారాంశం కృత్రిమ మేధస్సు సాధనాలను ఉపయోగించి అనువదించబడింది మరియు ఇంకా సమీక్షించబడలేదు లేదా ధృవీకరించబడలేదు.
Top