మెడికల్ ఎథిక్స్లో పురోగతి
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

సార్కోమా సెల్ లైన్ ప్రోగ్రెషన్ సిరీస్ నుండి సార్కోమా జీవశాస్త్రంలో అంతర్దృష్టి

Jiri Hatina, Michaela Kripnerova, Hamendra Singh Parmar, Zbynek Houdek, Pavel Dvorak, Katerina Houfkova, Martin Pesta, Jitka Kuncova, Sieghart Sopper, Lenka Radova, Jiri Sana, Ondrej Slaby

మృదు కణజాల సార్కోమాలు క్లినికల్ ప్రవర్తనలో వాటి గొప్ప వైవిధ్యానికి ప్రసిద్ధి చెందాయి, దాదాపు నిష్క్రియాత్మక గాయాల నుండి వేగంగా మెటాస్టేజింగ్ ట్యూమర్‌ల వరకు ఉంటాయి. సార్కోమా పురోగతికి కారణమైన జన్యువులు ఇప్పుడు పేలవంగా వర్గీకరించబడ్డాయి. ఈ దిశగా, మేము రెండు సింగిల్-బ్యాక్‌గ్రౌండ్ ప్రోగ్రెషన్ సిరీస్ మురిన్ సార్కోమా సెల్ లైన్‌ల ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్‌లను సమగ్రంగా విశ్లేషించాము. వి-జూన్ ట్రాన్స్‌జెనిక్ మౌస్‌లోని వరుస ఫైబ్రోసార్కోమాస్ నుండి మేము స్థాపించిన మొదటిది, నెమ్మదిగా విస్తరిస్తున్న నాన్‌మోటైల్ మరియు నాన్‌వాసివ్ సెల్ లైన్ JUN-2, వేగంగా విస్తరిస్తున్న, మోటైల్ మరియు ఇన్వాసివ్ సెల్ లైన్ JUN-3 మరియు సెల్ లైన్ JUN-. 2fos-3 ఒక ప్రత్యేకమైన పరివర్తన నమూనాను ప్రదర్శిస్తుంది, ఇది కణాల పెరుగుదల మరియు విస్తరణ యొక్క తక్కువ నియంత్రణతో, కానీ ఉచ్ఛరించబడుతుంది చలనశీలత మరియు చొరబాటు. రెండవది, ఫ్రెంచ్ సమూహంచే స్థాపించబడింది, విస్తృతంగా ఉపయోగించే ప్రీ-అడిపోసైటిక్ సెల్ లైన్ 3T3L1 మరియు దాని డెరివేటివ్ లిపోసార్కోమా సెల్ లైన్ LM3D. రెండు లిపోసార్కోమా కణ తంతువుల నుండి, మేము పుటేటివ్ లిపోసార్కోమా మూలకణాలను (సైడ్-పాపులేషన్ సెల్స్‌గా) వేరు చేసాము. మేము నాలుగు సెట్ల జీనోమ్-వైడ్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమిక్ విశ్లేషణలను చేసాము. JUN-ఫైబ్రోసార్కోమా ప్రోగ్రెషన్ సిరీస్, వ్యక్తిగత కణ తంతువుల మధ్య పరివర్తన సంబంధిత-లక్షణాల యొక్క ప్రత్యేకమైన పంపిణీ కారణంగా, సార్కోమా పురోగతిలో తాత్కాలికంగా పాల్గొన్న జన్యువుల యొక్క రెండు వేర్వేరు సమూహాలను గుర్తించడం మాకు సాధ్యపడింది. సంబంధిత జన్యువులు JUN-2 మరియు JUN-2fos3 రెండింటితో పోలిస్తే JUN-3లో వాటి అవకలన వ్యక్తీకరణ ద్వారా గుర్తించబడతాయి మరియు, మరోవైపు, JUN-2తో పోలిస్తే JUN-2fos3 మరియు JUN-3 కణాలలో వాటి సాధారణ వ్యక్తీకరణ నమూనా ద్వారా చలనశీలత మరియు ఇన్వాసివ్‌నెస్-సంబంధిత జన్యువులను గుర్తించవచ్చు. లిపోసార్కోమా ప్రోగ్రెషన్ సిరీస్‌కి సంబంధించి, మేము ఒక వైపు, ప్రోగ్రెషన్ జన్యువులను, వాటి అవకలన వ్యక్తీకరణ ద్వారా ప్రీ-అడిపోసైటిక్ 3T3L1 కణాలకు వర్సెస్ లిపోసార్కోమా LM3D కణాలలో మరియు మరోవైపు, సైడ్-పాపులేషన్ కణాలకు వ్యతిరేకంగా ప్రొఫిల్ చేయడం ద్వారా స్టెమ్‌నెస్ జన్యువులను గుర్తించాము. రెండు సెల్ లైన్ల నుండి నాన్-సైడ్ పాపులేషన్ సెల్స్. జీన్‌షిప్ మౌస్ జీనోమ్ 430 2.0 అర్రే (థర్మోఫిషర్ సైంటిఫిక్) ఉపయోగించి అధిక-నిర్గమాంశ జన్యు వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణ నిర్వహించబడింది. చివరగా, JUN-3 మరియు LM3D అత్యంత రూపాంతరం చెందిన కణాలు ("సార్కోమా పురోగతి" సంతకం) రెండింటిలోనూ సహ-నియంత్రణ చేయబడిన జన్యువుల యొక్క చిన్న సమూహాన్ని మేము గుర్తించాము. ఈ "సార్కోమా ప్రోగ్రెషన్" సంతకం యొక్క అద్భుతమైన లక్షణం కానానికల్ Wnt/β-catenin సిగ్నలింగ్ మార్గం యొక్క సంక్లిష్టమైన నియంత్రణ. అధిక నియంత్రణ జన్యువులు Wnt/β-catenin ఇన్హిబిటర్స్ (Dickkopf-2 మరియు -3, Apcdd1, Meg3, Fibulin-5, Ints6, Msx1) వలె ప్రచురించబడిన ఫంక్షన్‌తో విస్తృతమైన జన్యువులను కలిగి ఉంటాయి, మరోవైపు, వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్ క్రియాశీలతను గట్టిగా సూచిస్తుంది. Wnt5-Ror2 నాన్‌కానానికల్ మార్గం. మరొక విస్తృతమైన జన్యు సమితిలో జన్యువులు ఉన్నాయి, దీని ఎలివేటెడ్ ఎక్స్‌ప్రెషన్ వివిధ కార్సినోమాలలో పేలవమైన రోగ నిరూపణను సూచిస్తుంది, అయినప్పటికీ సార్కోమాస్‌లో దీని వ్యక్తీకరణ ఇప్పుడు విశ్లేషించబడలేదు. ఈ జన్యువులలో Snx6, uea ట్రాన్స్పోర్టర్ Slc14A1, Dpysl3, Ulk2,తాత్కాలిక గ్రాహక సంభావ్య కాల్షియం ఛానల్ Trpc1, Steap3, Morc4, Crp2 మరియు కరోనిన్ 1C). కొన్ని మృదు కణజాల సార్కోమా రకాలు లేదా ఆస్టియోసార్కోమా (Tbx3, Tgfbi, Rab3ip, Alcam, Crabp1, Ecm1, periostin)లో కొన్ని జన్యువులు ఇప్పటికే పేలవమైన రోగనిర్ధారణ సూచికలుగా వర్ణించబడ్డాయి. ఆసక్తికరంగా, ఫైబ్రోసార్కోమా మరియు లిపోసార్కోమా ప్రోగ్రెషన్ సిరీస్ రెండింటి యొక్క బల్క్ సెల్ పాపులేషన్ విశ్లేషణలో ఇన్‌పుట్‌ను అందించినప్పటికీ, "సార్కోమా ప్రోగ్రెషన్" సంతకంలోని అధిక క్రమబద్ధీకరించబడిన జన్యువులలో కొంత భాగం స్టెమ్‌నెస్ యాక్టివేషన్ (సి-జూన్ మరియు జన్యువుల కోడింగ్‌ను బలంగా గుర్తు చేస్తుంది. యాక్టివేటర్లు-Ddx21 మరియు Mfap, అలాగే కాండం అనుబంధిత ప్రత్యామ్నాయం కోసం జన్యువుల కోడింగ్ స్ప్లికింగ్ కారకాలు Khdrbs3 మరియు Mbln3, అలాగే Lis1, అసమాన మూలకణ విభజనలో పాల్గొన్నట్లు కనిపిస్తోంది). లేకపోతే, స్టెమ్‌నెస్ రెగ్యులేషన్‌లో సంబంధిత సార్కోమా ప్రోగ్రెషన్ సిరీస్‌లు రెండింటిలోనూ విభిన్న కారకాలు ఆధిపత్యం చెలాయిస్తున్నాయి, JUN-3 ఫైబ్రోసార్కోమా కణాలలో Sox-2 సంభావ్య అభ్యర్థి మరియు హిప్పో-పాత్‌వే జన్యువుల విస్తృత శ్రేణి (Yap, FoxM1, Pttg, Tacc3, Btf3, అలాగే Lats2) అడిపోసైటిక్ మరియు రెండింటిలోనూ నియంత్రించబడుతోంది లిపోసార్కోమా మూల కణాలు. మా నమూనాలు మరియు వాటి ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమిక్ విశ్లేషణ ద్వారా గుర్తించబడిన విభిన్నంగా వ్యక్తీకరించబడిన జన్యువులు మృదు కణజాల సార్కోమా యొక్క జీవశాస్త్రంపై ముఖ్యమైన కొత్త సమాచారాన్ని అందించగలవని మరియు ఈ అరుదైన మరియు అత్యంత భిన్నమైన కణితి రకం కోసం కొత్త ప్రోగ్నోస్టిక్ మార్కర్‌లను మరియు సంభావ్య చికిత్సా లక్ష్యాలను గుర్తించడంలో సహాయపడతాయని మేము నమ్ముతున్నాము.