ఇమ్యునోథెరపీ: ఓపెన్ యాక్సెస్
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

పసిఫిక్ ఓస్టెర్ యొక్క ఇమ్యూన్ ట్రాన్స్క్రిప్ట్స్: క్రాసోస్ట్రియా గిగాస్ లార్వా బాక్టీరియా ఛాలెంజ్ ఫలితంగా వ్యక్తీకరణలో మార్పు

జింగ్ ఫాంగ్, జియావోహుయ్ కాయ్, ఫెంగీ మావో, హాంగ్యు లి, హాంగ్లిన్ చెన్, మిన్హువా కియాన్, జాకబ్ ఆర్. హాంబ్రూక్, పాట్రిక్ సి. హానింగ్టన్, జిన్‌జాంగ్ వు

నేపధ్యం: సముద్రపు మొలస్క్‌లు అంతర్‌టైడల్ మరియు ఈస్ట్యురైన్ ప్రాంతాలలో నివసించే గుల్లలు, వాటి అభివృద్ధి సమయంలో అనేక వ్యాధికారక సవాళ్లను ఎదుర్కొంటాయి. Vibrio alginolyticus వంటి బ్యాక్టీరియా నుండి ఇన్ఫెక్షన్ , లార్వా అభివృద్ధిని ప్రభావితం చేసే ప్రధాన కారకాన్ని సూచిస్తుంది మరియు తరచుగా పసిఫిక్ ఓస్టెర్, క్రాసోస్ట్రియా గిగాస్ యొక్క అధిక మరణాలకు దారితీస్తుంది . ఓస్టెర్ రోగనిరోధక ప్రతిస్పందన సంక్రమణ యొక్క పరిణామాలను తగ్గించడం ద్వారా అభివృద్ధి సమయంలో జంతువును రక్షించడంలో ముఖ్యమైన పాత్ర పోషిస్తుంది.

ఫలితాలు: ఈ అధ్యయనంలో, మేము V. ఆల్జినోలిటికస్ ఛాలెంజ్‌కి C. గిగాస్ లార్వా యొక్క రోగనిరోధక ప్రతిస్పందన యొక్క సమగ్ర విశ్లేషణను చేపట్టాము . మేము లార్వా C. గిగాస్ యొక్క ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్‌ను 0 గంటలకు క్రమబద్ధీకరించాము, అంటే లార్వా ఓస్టెర్‌ను ఎటువంటి చికిత్స లేకుండా నియంత్రణ మరియు 6, 12, 24, 48 మరియు 72 గంటల తర్వాత ఇన్ఫెక్షన్ తర్వాత. RNA-seq తర్వాత, ముడి రీడ్‌లు NCBI సీక్వెన్స్ రీడ్ ఆర్కైవ్ ద్వారా యాక్సెస్ నంబర్ PRJNA623063 క్రింద అందుబాటులో ఉంటాయి. ఫిల్టర్ చేసిన తర్వాత, C. గిగాస్ యొక్క రిఫరెన్స్ జీనోమ్‌ని ఉపయోగించి మొత్తం 58.24 Gb క్లీన్ రీడ్‌లు ఉత్పత్తి చేయబడ్డాయి మరియు అసెంబుల్ చేయబడ్డాయి . నాణ్యత Q30 పంపిణీ ప్రతి నమూనాకు 90.88% కంటే ఎక్కువగా ఉంది మరియు GC కంటెంట్ 41.27% నుండి 42.91% వరకు ఉంది. COG, GO, KEGG, స్విస్-ప్రోట్ మరియు NR డేటాబేస్‌లలోని సీక్వెన్స్‌లతో పోల్చినప్పుడు, 1,267, 1,112, 2,187, 682, 1,133 విభిన్నంగా వ్యక్తీకరించబడిన జన్యువులు వరుసగా 6, 12, 272, 48, 48 గంటల తర్వాత ఉల్లేఖించబడ్డాయి. . అనేక రోగనిరోధక-సంబంధిత జన్యువులు కాలక్రమేణా మారుతూ ఉండే అవకలన వ్యక్తీకరణను ప్రదర్శించాయి: టోల్-లాంటి గ్రాహకాలు, త్రైపాక్షిక మోటిఫ్ ప్రోటీన్లు, లెక్టిన్ లాంటి కారకాలు, స్కావెంజర్ గ్రాహకాలు, మైలోయిడ్ డిఫరెన్సియేషన్ ఫ్యాక్టర్ 88 వంటి సిగ్నలింగ్ పాత్‌వే భాగాలు మరియు హీట్ షాక్ 70 kDa ప్రోటీన్ వంటి ఒత్తిడి ప్రోటీన్‌లు V. ఆల్జినోలిటికస్ ఛాలెంజ్‌తో పోల్చితే సమృద్ధిగా అన్నింటిలో ఎక్కువగా ఉన్నట్లు కనుగొనబడింది నియంత్రణ. విశ్లేషణ కోసం, ఈ జన్యువులు నమూనా గుర్తింపు గ్రాహకాలు, ఫైబ్రినోజెన్-వంటి ప్రోటీన్లు, నష్టం-అనుబంధ పరమాణు నమూనాలు, పూరక కారకాలు మొదలైన అనేక వర్గాలుగా విభజించబడ్డాయి. మేము నిజానికి C. గిగాస్ లార్వాలో అనేక డౌన్-రెగ్యులేటెడ్ రోగనిరోధక-సంబంధిత జన్యువులను కూడా కనుగొన్నాము. TRIM2, TRIM45, TRIM56 వంటి ఇన్ఫెక్షన్ యొక్క మొదటి 72 గంటలలో, TRIM71, మాక్రోఫేజ్ మన్నోస్ రిసెప్టర్ 1, అపోలిపోప్రొటీన్ D, సైటోక్రోమ్ P450, Rho-సంబంధిత ప్రోటీన్, ఒత్తిడి-ప్రేరిత ప్రోటీన్ 1, HSP68 , HSP75 , HSP70 B2, హేమ్-బైండింగ్ ప్రోటీన్ 1, హేమ్-బైండింగ్ ప్రోటీన్ 2, హెవీ-బైండింగ్ ప్రోటీన్, HIP మెటల్- హెమిసెంటిన్-1, మొదలైనవి. ఈ సాధారణ వర్గాలు ఉత్పత్తి చేయడానికి మమ్మల్ని అనుమతించాయి సంక్రమణ యొక్క మొదటి 72 గంటలలో C. గిగాస్ కోసం రోగనిరోధక ప్రతిస్పందన ప్రొఫైల్ . ఈ ఫలితాలు బ్యాక్టీరియా సంక్రమణ C. గిగాస్ లార్వాలో రోగనిరోధక జన్యు వ్యక్తీకరణ యొక్క సంక్లిష్ట నమూనాను ప్రేరేపిస్తుందని సూచిస్తున్నాయి .

ముగింపు: మా అధ్యయనం అకశేరుక రోగనిరోధక అణువుల వైవిధ్యం మరియు పరిణామాన్ని వివరించే నిర్దిష్ట రోగనిరోధక కారకాల పనితీరుపై లక్ష్య పరిశోధనను సులభతరం చేస్తుంది మరియు ఓస్టెర్ సంస్కృతి పనితీరును మెరుగుపరచడానికి సమర్థవంతమైన చర్యల అభివృద్ధికి దారి తీస్తుంది.