ISSN: 2329-6917
సునీత కొడిదెల, సురేష్ చంద్ర ప్రధాన్, జయరామన్ ముత్తుకుమారన్, బిస్వజిత్ దుబాషి, తెరెసా శాంటోస్-సిల్వా మరియు దేబ్దత్తా బసు
లక్ష్యాలు: భారతీయ జనాభాలో డైహైడ్రోఫోలేట్ రిడక్టేజ్ (DHFR) -317A>G మరియు -680C>A వేరియంట్ల యొక్క యుగ్మ వికల్పం మరియు జన్యురూప పౌనఃపున్యాలను స్థాపించడం, తీవ్రమైన లింఫోబ్లాస్టిక్ లుకేమియా (ALL) ప్రమాదంతో ఈ వైవిధ్యాల అనుబంధాన్ని కనుగొనడం మరియు విశ్లేషించడం పర్యాయపదాలు కాని SNPల ప్రభావాలు (nsSNPs) మరియు 3'అన్-సిలికో సాధనాలను ఉపయోగించి దాని నిర్మాణం మరియు పనితీరుపై DHFR జన్యువు యొక్క అనువదించని ప్రాంతం (3'UTR) వైవిధ్యాలు.
పద్ధతులు: అధ్యయనం కోసం మొత్తం 235 మంది సంబంధం లేని ఆరోగ్యకరమైన వాలంటీర్లు (నియంత్రణలు) మరియు 127 మంది రోగులను (కేసులు) నియమించారు. DNA పరిధీయ ల్యూకోసైట్ల నుండి సంగ్రహించబడింది. DHFR పాలిమార్ఫిజమ్ల జన్యురూపం నిజ సమయ PCR ద్వారా చేయబడింది. మేము గణన ప్లాట్ఫారమ్ల ద్వారా DHFR జన్యువు యొక్క 3'UTRలో nsSNPలు మరియు వైవిధ్యాల యొక్క హానికరమైన ప్రభావాన్ని పరిశోధించాము.
ఫలితాలు: ప్రస్తుత అధ్యయనంలో, DHFR -317G మరియు -680 A యుగ్మ వికల్పాల ఫ్రీక్వెన్సీ వరుసగా 33.3% మరియు 59.8%గా కనుగొనబడింది. అధ్యయనం చేయబడిన DHFR వేరియంట్లు (rs408626 మరియు rs442767) అందరికీ గణనీయమైన ప్రమాదాన్ని అందించలేదు. మూడు nsSNP లు DHFR ప్రోటీన్ యొక్క నిర్మాణం, పనితీరు మరియు కార్యాచరణను సమర్థవంతంగా ప్రభావితం చేస్తాయని ఇన్సిలికో విశ్లేషణ వెల్లడించింది. 3'UTR SNPల కారణంగా నాలుగు మైక్రోఆర్ఎన్ఎ బైండింగ్ సైట్లు ఎక్కువగా ప్రభావితమైనట్లు కనుగొనబడింది. ఇంకా, డాకింగ్ సిమ్యులేషన్ స్థానిక మరియు DHFR యొక్క మూడు ఉత్పరివర్తన రూపాల పట్ల మెథోట్రెక్సేట్ యొక్క బంధన క్రమాన్ని D153V (rs121913223)>స్థానిక>G18R (rs61736208)>D187Y (rs205090) అని సూచించింది.
ముగింపు: భారతీయ జనాభాలో DHFR వేరియంట్ల యొక్క సాధారణ జన్యురూప పంపిణీని నివేదించడానికి మరియు DHFR (-317A>G మరియు -680C>A) వేరియంట్లు ALL అభివృద్ధికి సంభావ్య ప్రమాదాన్ని అందించవని నివేదించడానికి ఇది మొదటి అధ్యయనం. DHFR వేరియంట్ జన్యురూపాల పంపిణీలో అంతర్-జాతి వ్యత్యాసాలు ఉన్నాయి మరియు ఇది DHFR సబ్స్ట్రేట్లకు చికిత్సా ప్రతిస్పందనలో వైవిధ్యానికి దారి తీస్తుంది. ప్రొటీన్ సీక్వెన్స్ విశ్లేషణ rs200904105 DHFR యొక్క ఫాస్ఫోరైలేషన్ ప్రక్రియను (అనువాద అనంతర సవరణ) ప్రభావితం చేస్తుందని వెల్లడించింది మరియు డాకింగ్ సిమ్యులేషన్ మెథోట్రెక్సేట్ను rs121913223 ఉత్పరివర్తన రూపం పట్ల అధిక అనుబంధాన్ని కలిగి ఉండాలని సూచించింది. అందువల్ల, భారతీయ జనాభాలో ఈ వైవిధ్యాల యొక్క క్లినికల్ ప్రభావాన్ని అన్వేషించడానికి అధ్యయనాలు హామీ ఇవ్వబడ్డాయి.