బయాలజీ & మెడిసిన్లో అధునాతన సాంకేతికతలు
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

యాంటిజెన్ రిట్రీవల్ టెక్నిక్స్ ఫార్మాలిన్ ఫిక్స్‌డ్ పారాఫిన్ ఎంబెడెడ్ టిష్యూ నుండి DNA దిగుబడిని మెరుగుపరుస్తాయా?

సుభాష్ గోవేందర్ మరియు రిచర్డ్ నేడూ

ఈ అధ్యయనం ఫార్మాలిన్ ఫిక్స్‌డ్ పారాఫిన్ ఎంబెడెడ్ (FFPE) కణజాలాల నుండి అధిక నాణ్యత గల DNA యొక్క వెలికితీత కోసం వాంఛనీయ ప్రోటోకాల్‌ను నిర్ణయించడానికి వేరియబుల్ pHల వద్ద విభిన్న పునరుద్ధరణ పరిష్కారాలతో ఒత్తిడి వంటను ఉపయోగించడాన్ని పరిశోధించింది. ఇంకా, కణజాల బ్లాకుల వయస్సుకు సంబంధించి ఆర్కైవ్ చేయబడిన FFPE కణజాలాలపై ఆక్సీకరణ ప్రభావం కూడా అన్వేషించబడింది. 11 గ్యాస్ట్రిక్ క్యాన్సర్‌లపై ఈ పద్ధతిని పరిశోధించడం అధ్యయనం యొక్క ప్రధాన లక్ష్యం. మా అధ్యయనం యొక్క రూపకల్పన FFPE కణజాలాల నుండి సేకరించిన DNA నాణ్యతను మెరుగుపరచడానికి సంప్రదాయ ప్రెజర్ కుక్కర్‌ను ఉపయోగించి యాంటిజెన్ రిట్రీవల్ టెక్నిక్ సూత్రాలపై ఆధారపడింది. గ్యాస్ట్రిక్ క్యాన్సర్‌లతో పాటు, కణజాల పక్షపాతాన్ని తొలగించడానికి లింఫోమా, రొమ్ము, ప్రోస్టాటిక్ మరియు కొలొరెక్టల్ కార్సినోమాలు ఉపయోగించబడ్డాయి. జత చేసిన టి-టెస్ట్ మరియు బెంజమిని-హోచ్‌బర్గ్ పరీక్షను ఉపయోగించి గణాంక సహసంబంధం జరిగింది. ఈ విధానానికి లోబడి లేని నియంత్రణ నమూనాలతో పోలిస్తే, ప్రెజర్ వంటతో విభిన్న రిట్రీవల్ సొల్యూషన్‌లను ఉపయోగించి అధిక DNA సాంద్రతలు పొందినట్లు మా పరిశోధనలు చూపిస్తున్నాయి. పరీక్షించిన అన్ని పరిష్కారాలతో సగటు DNA ఏకాగ్రత పెరిగింది కానీ ఉపయోగించిన 4 రిట్రీవల్ సొల్యూషన్‌లలో 3లో DNA దిగుబడి గణనీయంగా ఎక్కువగా ఉంది. ప్రెజర్ వంట ద్వారా అందించబడిన అధిక పీడనం మరియు ఉష్ణోగ్రత వద్ద యాంటిజెన్ రిట్రీవల్ సొల్యూషన్‌ల ఉపయోగం FFPE కణజాలాలలో ఫార్మాలిన్ యొక్క క్రాస్‌లింకింగ్ ప్రభావాన్ని తిప్పికొట్టవచ్చు. ఇంకా, ఇటీవల ప్రాసెస్ చేయబడిన బ్లాక్‌ల నుండి సేకరించిన DNA పాత టిష్యూ బ్లాక్‌ల కంటే మెరుగైన దిగుబడిని కలిగి ఉందని పరిశీలన, ఆక్సీకరణ DNA పై క్షీణించే ప్రభావాన్ని కలిగి ఉందని నిర్ధారిస్తుంది.