ISSN: 2379-1764
జూలియన్ పీలే, బ్రూక్ టాడ్డేస్, మడేలిన్ డెనియాడ్, ఆంటోయిన్ గార్నియర్, డేనియల్ హెన్రియన్, హెర్వే అబ్ది మరియు మేరీ చాబెర్ట్
బహుళ శ్రేణి సమలేఖనంలో, నిర్మాణ, క్రియాత్మక మరియు/లేదా ఫైలోజెనెటిక్ పరిమితుల నుండి క్రమం సహ-వైవిధ్యాలు ఏర్పడతాయి. కో-వేరియేషన్ స్కోర్లను లెక్కించడానికి అనేక పద్ధతులు అభివృద్ధి చేయబడ్డాయి, అయితే ప్రోటీన్ ఫ్యామిలీ డైవర్జెన్స్ యొక్క విశ్లేషణకు ఏ పద్ధతులు బాగా సరిపోతాయో గుర్తించడానికి కొన్ని అధ్యయనాలు ఈ పద్ధతులను పోల్చాయి. ఇక్కడ, మేము విస్తృతంగా ఉపయోగించే పద్ధతుల యొక్క అవలోకనాన్ని ఇస్తాము మరియు తగిన పద్ధతుల ఎంపిక కోసం సాధారణ నియమాలను గుర్తించాము. ప్రత్యేకించి, OMES మరియు ELSC వంటి పద్ధతులు-ఇంటర్మీడియట్ ఎంట్రోపీ మరియు హబ్ నిర్మాణంతో కూడిన కోవేరియేషన్ నెట్వర్క్లతో జతలకు అనుకూలంగా ఉంటాయి-కుటుంబ వైవిధ్యంపై పరిణామాత్మక సమాచారాన్ని వెల్లడించడానికి బాగా సరిపోతాయని మేము కనుగొన్నాము. G ప్రోటీన్-కపుల్డ్ గ్రాహకాలకు వర్తించినప్పుడు, ఈ పద్ధతులు ప్రోటీన్ పరిణామం యొక్క ఎపిస్టాసిస్ మోడల్కు మద్దతు ఇస్తాయి, దీనిలో కీలకమైన మ్యుటేషన్ తర్వాత, ప్రోటీన్ పనితీరును పునరుద్ధరించడానికి మరియు/లేదా మార్చడానికి అనేక అవశేషాల సహ-పరిణామం అవసరం.