జర్నల్ ఆఫ్ క్లినికల్ ట్రయల్స్
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

పాన్-క్యాన్సర్‌లో PTEN జన్యువు యొక్క సమగ్ర జీవసంబంధ సమాచార విశ్లేషణ

హాంగ్ జాంగ్†, వెన్హాన్ జౌ, జియావోయి యాంగ్, షుజాన్ వెన్, బైచెంగ్ జావో, జియాలే ఫెంగ్, బోజౌ చెన్, షుయింగ్ చెన్*

నేపథ్యం: PTEN అనేది వివిధ రకాల క్యాన్సర్‌లలో అధిక పౌనఃపున్యం వద్ద పరివర్తన చెందే మల్టీఫంక్షనల్ ట్యూమర్ సప్రెసర్ జన్యువు. అయినప్పటికీ, పాన్-క్యాన్సర్, సహసంబంధ జన్యువులు, మనుగడ రోగ నిరూపణ మరియు నియంత్రణ మార్గాలలో దాని వ్యక్తీకరణ పూర్తిగా వివరించబడలేదు. ఇక్కడ, మేము క్లినికల్ అప్లికేషన్ కోసం సూచనను అందించడానికి పై దృక్కోణాల నుండి సమగ్ర విశ్లేషణను నిర్వహించాలని లక్ష్యంగా పెట్టుకున్నాము. పద్ధతులు: మేము TCGA మరియు GTEx డేటాబేస్ నుండి డేటాను ఉపయోగించడం ద్వారా క్యాన్సర్‌లలో వ్యక్తీకరణ స్థాయిలను అధ్యయనం చేసాము. UALCAN డేటాబేస్ నుండి ఎక్స్‌ప్రెషన్ బాక్స్ ప్లాట్‌ను పొందండి, cBioportal వెబ్‌సైట్‌లో మ్యుటేషన్ విశ్లేషణను నిర్వహించండి,
GEPIA వెబ్‌సైట్‌లో సహసంబంధ జన్యువులను పొందండి, ప్రోటీన్ నెట్‌వర్క్‌ను నిర్మించి మరియు STRING డేటాబేస్‌లో KEGG మరియు GO ఎన్‌రిచ్‌మెంట్ విశ్లేషణను నిర్వహించండి మరియు కప్లాన్-మీర్ ప్లాటర్ వెబ్‌సైట్‌లో ప్రోగ్నోస్టిక్ విశ్లేషణను నిర్వహించండి. మేము RNAup వెబ్ సర్వర్ మరియు RPISeqలో PROMO డేటాబేస్ మరియు RNA-RNA అసోసియేషన్/RNA-ప్రోటీన్ ఇంటరాక్షన్‌పై ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్ ఫ్యాక్టర్ ప్రిడిక్షన్‌ను కూడా ప్రదర్శించాము. జన్యు 3D నిర్మాణం, ప్రోటీన్ సీక్వెన్స్ మరియు సంరక్షించబడిన డొమైన్ NCBI నుండి పొందబడ్డాయి.
ఫలితాలు: మేము అధ్యయనం చేసిన అన్ని క్యాన్సర్లలో PTEN తక్కువగా వ్యక్తీకరించబడింది. ఇది కణితుల యొక్క క్లినికల్ దశకు దగ్గరి సంబంధం కలిగి ఉంది, PTEN క్యాన్సర్ అభివృద్ధి మరియు పురోగతిలో పాల్గొనవచ్చని సూచిస్తుంది. PTEN యొక్క ఉత్పరివర్తనలు వివిధ రకాల క్యాన్సర్‌లలో ఉన్నాయి, వీటిలో ఎక్కువ భాగం కత్తిరించే ఉత్పరివర్తనలు మరియు మిస్సెన్స్ ఉత్పరివర్తనలు. క్యాన్సర్లలో (KIRC, LUAD, THYM, UCEC, గ్యాస్ట్రిక్ క్యాన్సర్, కాలేయ క్యాన్సర్, ఊపిరితిత్తుల క్యాన్సర్, రొమ్ము క్యాన్సర్), PTEN యొక్క తక్కువ వ్యక్తీకరణ కలిగిన రోగులకు తక్కువ OS సమయం మరియు పేద OS రోగ నిరూపణ ఉంటుంది. PTEN యొక్క తక్కువ వ్యక్తీకరణ కొన్ని క్యాన్సర్లలో (TGCT, UCEC, LIHC, LUAD, THCA) RFS క్షీణతకు కారణమవుతుంది, PTEN యొక్క వ్యక్తీకరణ క్లినికల్ రోగ నిరూపణకు సంబంధించినదని సూచిస్తుంది. మా అధ్యయనం PTENతో పరస్పర సంబంధం ఉన్న జన్యువులను గుర్తించింది మరియు GEPIA వెబ్‌సైట్ నుండి పొందిన 100 PTEN సంబంధిత జన్యువులపై GO ఎన్‌రిచ్‌మెంట్ విశ్లేషణను నిర్వహించింది. ముగింపు: PTEN జన్యువు యొక్క అవగాహన మరియు దాని సంబంధిత నియంత్రణ మార్గాల యొక్క లోతైన అన్వేషణ కణితి-నిర్దిష్ట బయోమార్కర్లు మరియు క్లినికల్ సంభావ్య చికిత్సా లక్ష్యాల ఆవిష్కరణకు అంతర్దృష్టిని అందించవచ్చు.