అప్లైడ్ మైక్రోబయాలజీ: ఓపెన్ యాక్సెస్
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

కనైన్ యూరినరీ ట్రాక్ట్ ఇన్ఫెక్షన్‌లతో సంబంధం ఉన్న వ్యాధికారకాలను గుర్తించడానికి ప్రామాణిక యూరిన్ కల్చర్‌తో మల్టీప్లెక్స్ రియల్-టైమ్ PCR పోలిక

సమంతా జె గైడా, జోసెఫ్ బార్ట్గెస్, రెబెకా జోన్స్, కాలేబ్ యంగ్, మరియా సెకనోవా

యాంటీమైక్రోబయల్ ససెప్టబిలిటీ టెస్టింగ్ (UCS)తో కూడిన సాంప్రదాయిక ఏరోబిక్ మైక్రోబియల్ యూరిన్ కల్చర్ అనేది కుక్కల బాక్టీరియల్ యూరినరీ ట్రాక్ట్ ఇన్ఫెక్షన్స్ (BUTIs) నిర్ధారణకు సూచన ప్రమాణం. ఎమర్జింగ్ మల్టీప్లెక్స్ రియల్-టైమ్ PCR (qPCR) UCSతో కలిసి నిర్వహించినప్పుడు ఉపయోగకరమైన రోగనిర్ధారణ పరీక్ష కావచ్చు. కుక్కల మూత్రంలో యూరోపాథోజెన్‌లను గుర్తించడం కోసం qPCR ను UCSతో పోల్చడం ఈ అధ్యయనం యొక్క లక్ష్యం. కనైన్ యూరోపాథోజెన్‌ల యొక్క ఇరవై మూడు స్తంభింపచేసిన ఐసోలేట్‌లు ఒక ఆర్కైవ్ నుండి ఎంపిక చేయబడ్డాయి మరియు బ్లడ్ అగర్ ప్లేట్‌లపై పెంచబడ్డాయి. బ్లడ్ అగర్‌పై పెరుగుదల తరువాత, ప్రతి ఐసోలేట్ నుండి కాలనీలు స్టెరైల్ కుక్కల మూత్రంలోకి టీకాలు వేయబడ్డాయి, 23 సానుకూల కృత్రిమ మూత్ర నమూనాలను సృష్టించాయి. మూత్రం నమూనాలు 38 ° C వద్ద 40 గంటలు పొదిగేవి. నమూనాలు 23 నమూనాల రెండు సెట్లుగా విభజించబడ్డాయి; మొదటి సెట్‌ను UCS విశ్లేషించింది మరియు రెండవ సెట్‌ను qPCR విశ్లేషించింది. స్టెరైల్ మూత్రం యొక్క రెండు నమూనాలు ప్రతికూల నియంత్రణలుగా ఉపయోగించబడ్డాయి. రెండు విశ్లేషణాత్మక ప్రయోగశాలలలో బ్లైండ్ యూరిన్ నమూనా పరీక్ష జరిగింది.

UCS 23 పాజిటివ్ ఐసోలేట్లలో 22లో యూరోపాథోజెన్‌లను సరిగ్గా గుర్తించింది. qPCR 23 ఐసోలేట్‌లలో 20లో యూరోపాథోజెన్‌లను సరిగ్గా గుర్తించింది. నియంత్రణలు బ్యాక్టీరియా పెరుగుదలను అందించలేదు. స్టెఫిలోకాకస్ స్క్లీఫెరీని కలిగి ఉన్న ఒక నమూనా UCS ద్వారా గుర్తించబడింది, కానీ qPCR కాదు; అయినప్పటికీ, qPCR 16S RNA ఉనికి ద్వారా పేర్కొనబడని యూరోపాథోజెన్‌ను గుర్తించింది. 3 నమూనాలలో, UCS ద్వారా కనుగొనబడని అదనపు జీవిని qPCR గుర్తించింది. ఘనీభవించిన ఐసోలేట్‌ల నుండి కుక్కల యూరోపాథోజెన్‌లను గుర్తించడానికి qPCR UCSతో పోల్చదగిన ఫలితాలను కలిగి ఉంది. సహజంగా సంభవించే యూరినరీ ట్రాక్ట్ ఇన్ఫెక్షన్ ఉన్న కుక్కల నుండి మూత్రంలో ఇలాంటి ఫలితాలు కనిపిస్తే, qPCR ఒక ఉపయోగకరమైన అనుబంధ రోగనిర్ధారణ సాధనంగా ఉపయోగపడుతుంది.