జర్నల్ ఆఫ్ క్లినికల్ ట్రయల్స్
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

బయోఇన్ఫర్మేటిక్ అనాలిసిస్: కొలొరెక్టల్ కార్సినోమాలో LINC00634 పాత్ర

ఫాంగ్ లియు, ఫెంగ్యిహువాన్ ఫు*, యుకియాంగ్ నీ

నేపధ్యం: LINC00634 అన్నవాహిక క్యాన్సర్‌లో ఎక్కువగా వ్యక్తీకరించబడింది మరియు దాని క్షీణత సాధ్యతను అణిచివేస్తుంది మరియు అన్నవాహిక క్యాన్సర్ కణాల అపోప్టోసిస్‌ను ప్రేరేపిస్తుంది. అయినప్పటికీ, LINC00634 వ్యక్తీకరణ మరియు క్లినిక్ రోగలక్షణ లక్షణాలు, మనుగడ ఫలితాలు, రోగనిర్ధారణ కారకాలు మరియు కొలొరెక్టల్ కార్సినోమా (CRC) రోగుల కణితి రోగనిరోధక కణాల చొరబాటు మధ్య సంబంధాన్ని పరిశీలించే అధ్యయనాల కొరత ఉంది.

లక్ష్యం: కొలొరెక్టల్ కార్సినోమాలో LINC00634 పాత్రను పరిశోధించాలని మేము లక్ష్యంగా పెట్టుకున్నాము.

పద్ధతులు: మేము TCGA (ది క్యాన్సర్ జీనోమ్ అట్లాస్) పబ్లిక్ డేటాబేస్, GTEx (జెనోటైప్-టిష్యూ ఎక్స్‌ప్రెషన్) డేటాబేస్ మరియు క్లినికల్ శాంపిల్స్ నుండి డేటాను పొందాము. LINC00634 వ్యక్తీకరణ మరియు CRC రోగుల క్లినికోపాథలాజికల్ లక్షణాల మధ్య సంబంధాన్ని అంచనా వేయడానికి విల్కాక్సన్ ర్యాంక్-సమ్ పరీక్ష, క్రుస్కల్-వాలిస్ పరీక్ష మరియు లాజిస్టిక్ రిగ్రెషన్ విశ్లేషణలను ఉపయోగించారు. ఏరియా అండర్ ది కర్వ్ (AUC) స్కోర్ ఆధారంగా CRC రోగులు మరియు సాధారణ సబ్జెక్టుల మధ్య తేడాను గుర్తించడానికి LINC00634 యొక్క సామర్థ్యాన్ని అంచనా వేయడానికి రిసీవర్ ఆపరేటింగ్ క్యారెక్టరిస్టిక్ (ROC) కర్వ్ నిర్మించబడింది. రోగనిర్ధారణ కారకాలు మరియు మనుగడ ఫలితాల మధ్య అనుబంధాన్ని అంచనా వేయడానికి ఏకరూప మరియు బహుళ విశ్లేషణలు నిర్వహించబడ్డాయి. కొలొరెక్టల్ కార్సినోమా రోగుల రోగ నిరూపణకు LINC00634 వ్యక్తీకరణ యొక్క సహకారాన్ని నిర్ణయించడానికి కప్లాన్-మీర్ వక్రతలు మరియు కాక్స్ రిగ్రెషన్ విశ్లేషణ ఉపయోగించబడ్డాయి. LINC00634 యొక్క గణనీయమైన ప్రమేయం ఉన్న విధులను గుర్తించడానికి రోగనిరోధక చొరబాటు విశ్లేషణ మరియు జీన్ సెట్ ఎన్‌రిచ్‌మెంట్ అనాలిసిస్ (GSEA) నిర్వహించబడ్డాయి. చివరగా, కాక్స్ రిగ్రెషన్ డేటా ఆధారంగా అంతర్గత ధృవీకరణ కోసం నోమోగ్రామ్ నిర్మించబడింది.

ఫలితాలు: LINC00634 యొక్క వ్యక్తీకరణ CRC రోగులలో నియంత్రించబడింది మరియు N దశ, అవశేష కణితి, రోగలక్షణ దశ మరియు మొత్తం సర్వైవల్ (OS) ఈవెంట్‌తో గణనీయంగా అనుబంధించబడింది. ROC కర్వ్ LINC00634 బలమైన రోగనిర్ధారణ మరియు రోగనిర్ధారణ సామర్ధ్యాలను కలిగి ఉందని చూపింది (AUC=0.74). LINC00634 యొక్క అధిక వ్యక్తీకరణ పేలవమైన వ్యాధి నిర్దిష్ట మనుగడ (DSS; P=0.008) మరియు పేలవమైన ఓవర్‌రోల్ మనుగడ (OS; P <0.01) అంచనా వేయగలదు. LINC00634 యొక్క వ్యక్తీకరణ CRC రోగులలో OSతో స్వతంత్రంగా అనుబంధించబడింది (P = 0.019). GSEA మరియు రోగనిరోధక చొరబాటు విశ్లేషణ LINC00634 వ్యక్తీకరణ జన్యు లిప్యంతరీకరణ, బాహ్యజన్యు నియంత్రణ మరియు కొన్ని రకాల రోగనిరోధక చొరబాటు కణాల విధుల్లో పాల్గొంటుందని నిరూపించాయి. నోమోగ్రామ్ యొక్క సి-ఇండెక్స్ 0.772 (95%CI: 0.744-0.799).

ముగింపు: CRC రోగులకు LINC00634 సంభావ్య ప్రోగ్నోస్టిక్ బయోమార్కర్‌గా ఉపయోగపడుతుందని మా అధ్యయనం వెల్లడిస్తుంది.