యాంటీవైరల్స్ & యాంటీరెట్రోవైరల్స్ జర్నల్
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

ఆస్ట్రేలియాలో కాంకరెన్స్ D614G స్పైక్ ప్రోటీన్ మ్యుటేషన్‌తో కరోనా వైరస్ Nsp2 RNA టోపోయిసోమర్స్ I120F మార్పుచెందగలవారి సమృద్ధిగా ప్రసారం

అసిత్ కె. చక్రవర్తి

మేము విబ్రియో హేమోలిటికా DNA టోపోయిసోమెరేస్ IA/IV అలాగే DNA ప్రైమేస్, DNA గైరేస్ మరియు ద్వి-సబ్యూనిట్ ట్రిపనోసోమా బ్రూసీ DNA టోపోయిసోమెరేస్ IB మధ్య అమైనో యాసిడ్ హోమోలజీ ద్వారా Nsp2 కరోనా వైరస్ ప్రోటీన్‌ను RNA టోపోయిసోమెరేస్‌గా గతంలో అంచనా వేసాము . అనేక DNA టోపోయిసోమెరేస్ I/III RNA టోపోయిసోమెరేస్ కార్యాచరణను కలిగి ఉంటాయి మరియు అటువంటి సర్వవ్యాప్త ఎంజైమ్‌లు సంరక్షించబడతాయి మరియు ప్రతిరూపణ మరియు లిప్యంతరీకరణ నియంత్రణలో పాల్గొంటాయి. మేము ఇక్కడ Nsp2 RNA టోపోయిసోమెరేస్ విశ్లేషణ > 10000 orf 1a 4405 అమైనో ఆమ్లం పొడవు కరోనా వైరస్ పాలీప్రొటీన్ యొక్క పరస్పర ప్రొఫైల్‌ను తనిఖీ చేసాము. 99.84% సీక్వెన్స్ సారూప్యత కలిగిన BLAST శోధన ద్వారా ఉత్పరివర్తన ప్రోటీన్‌లు ఎంపిక చేయబడ్డాయి మరియు 181- 818 aa భాగం NsP2 ప్రోటీన్ (ప్రోటీన్ id. QIU82057) CLUSTAL ఒమేగా సాఫ్ట్‌వేర్‌ను ఉపయోగించి విశ్లేషించబడింది. మేము 26 విభిన్న ఉత్పరివర్తనాలను కనుగొన్నాము, ఇక్కడ చాలా మార్పులు ఐసోలూసిన్ మరియు అలనైన్‌లో వాలైన్‌గా లేదా లూసిన్‌లో ఫెనిలానాలిన్‌గా ఎంపిక చేయబడ్డాయి, కరోనా వైరస్ RNA టోపోయిసోమెరేస్ యొక్క సంరక్షించబడిన స్వభావాన్ని గుర్తించడం. I120F (ఐసోలూసిన్ టు ఫెనిలాలనైన్) వద్ద చాలా విస్తారమైన ఉత్పరివర్తనలు కనుగొనబడ్డాయి. ఇతర ముఖ్యమైన ఉత్పరివర్తనలు R27C, I198V, T85I, L410F, I559V మరియు P583S. I120F మ్యుటేషన్ ఆస్ట్రేలియన్ ఐసోలేట్‌లలో పుష్కలంగా ఉంది మరియు దాని వ్యాప్తి బంగ్లాదేశ్ మరియు USA వంటి ఇతర దేశాలలో కనిపించింది. సమర్థవంతమైన వైరస్ ప్యాకేజింగ్ కోసం RNA నిర్మాణాన్ని స్థిరీకరించడం ద్వారా Nsp2 Topoisomerase యొక్క సమృద్ధిగా I120F మ్యుటేషన్ కరోనా వైరస్ ప్రసారాన్ని పెంచుతుందని మేము సూచిస్తున్నాము. ఆసక్తికరంగా, అటువంటి ఉత్పరివర్తనలు స్పైక్ ప్రోటీన్ యొక్క D614G మ్యుటేషన్‌కు అనుబంధంగా కనుగొనబడ్డాయి,> 70% ఇన్ఫెక్టివిటీని పెంచుతుంది. దీనికి విరుద్ధంగా, విశ్లేషించబడిన అన్ని P583S Nsp2 మార్పుచెందగలవారికి D614G స్పైక్ ప్రోటీన్ మ్యుటేషన్ లేదు. అనేక నిశ్శబ్ద ఉత్పరివర్తనలు (5-7) జన్యు విస్తృత విశ్లేషణ ద్వారా కనుగొనబడ్డాయి కానీ N501Y స్పైక్ ప్రోటీన్ మ్యుటేషన్ లేదు. ఇది Nsp2 ప్రోటీన్ I120F మ్యుటేషన్‌తో ఎక్కువ కరోనా వైరస్ ట్రాన్స్‌మిషన్ లింక్‌ను అంచనా వేసే మొదటి నివేదిక మరియు కొత్త యాంటీ-వైరల్ ఔషధాలను కనుగొనడంలో ముఖ్యమైనది కావచ్చు.