జర్నల్ ఆఫ్ థియరిటికల్ & కంప్యూటేషనల్ సైన్స్
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

ప్రోటీన్ సీక్వెన్స్‌పై B-ఫాక్టర్ బేస్‌ను అంచనా వేసే పరిశోధన

Runyu జింగ్, Yuelong వాంగ్, Yiming వు, Yongpan Hua, Xu Dai1 మరియు మెంగ్లాంగ్ లీ

B-కారకం, Debye-Waller కారకం లేదా ఉష్ణోగ్రత కారకం అని కూడా పిలుస్తారు, ఇది ప్రోటీన్ యొక్క సౌలభ్యం యొక్క వివరణ మరియు సాధారణంగా PDB (ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్) ఫార్మాట్ ఫైల్‌లలో ఉపయోగించబడుతుంది. x-రే స్కాటరింగ్ ద్వారా ప్రోటీన్ క్రిస్టల్ నుండి B-కారకాన్ని కొలవవచ్చు, కానీ ప్రోటీన్ సీక్వెన్స్ నుండి నేరుగా పొందలేము. అందువల్ల, ప్రోటీన్ సీక్వెన్స్ ఆధారంగా మాత్రమే B-కారకాన్ని అంచనా వేయడం సంబంధిత పరిశోధకులకు కొన్ని సూచనలను అందిస్తుంది. ఈ అధ్యయనంలో, మేము ప్రోటీన్ సీక్వెన్స్ ఆధారంగా B-కారకాన్ని అంచనా వేయడానికి ప్రయత్నిస్తాము. AAindexలోని సమాచారం మరియు అంచనా వేయబడిన ప్రోటీన్ ద్వితీయ నిర్మాణం, సాపేక్ష ప్రాప్యత, రుగ్మత మరియు శక్తి మార్పులు అమైనో ఆమ్ల అవశేషాలను వివరించడానికి ఉపయోగించబడతాయి. మోడలింగ్ మరియు ప్రిడిక్షన్ కోసం నాలుగు మెషిన్ లెర్నింగ్ పద్ధతులు ఉపయోగించబడతాయి. మోడలింగ్ పనితీరును అంచనా వేయడానికి 5 రెట్లు క్రాస్ ధ్రువీకరణ ఉపయోగించబడుతుంది. ఫలితంగా, ఈ పని ప్రోటీన్ సీక్వెన్స్ ఆధారంగా B-కారకాన్ని అంచనా వేయడానికి మరియు విశ్లేషించడానికి కొన్ని కొత్త పద్ధతులను అందించింది మరియు సంబంధిత పరిశోధనలకు ఈ పని సహాయకరంగా ఉంటుందని మేము ఆశిస్తున్నాము.