ఇమ్యునోథెరపీ: ఓపెన్ యాక్సెస్
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

పాన్-క్యాన్సర్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ మరియు సింగిల్ సెల్ డేటా ద్వారా బహిర్గతం చేయబడిన మ్యాట్రిక్స్ మెటాలోప్రొటీసెస్ ( MMP ) జీన్ ఎక్స్‌ప్రెషన్ ప్రొఫైల్ యొక్క దృక్కోణం

జింక్యాంగ్ టాన్*, యిడాన్ గావో, జావో లి, యువాన్యువాన్ వాంగ్, లిన్‌బాంగ్ వాంగ్

నేపధ్యం: MMPలు అనేవి క్యాన్సర్ పురోగతికి సంబంధించిన కుటుంబ జన్యువుల సమూహం, క్యాన్సర్‌లలోని చాలా MMP జన్యువుల నియంత్రణ, దండయాత్ర, యాంజియోజెనిసిస్ మరియు రోగనిరోధక నిఘా ఎగవేత ప్రమోషన్‌తో సంబంధం కలిగి ఉన్నట్లు నివేదించబడింది. అయినప్పటికీ, పాన్-క్యాన్సర్ కోణంలో ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ స్థాయి మరియు సింగిల్-సెల్ స్థాయిలో అన్ని MMPల యొక్క వ్యక్తీకరణ నమూనాలు పరిశోధించబడలేదు.

పద్ధతులు: GEO (జీన్ ఎక్స్‌ప్రెషన్ ఆమ్నిబస్) నుండి క్యాన్సర్ జీనోమ్ అట్లాస్ (TCGA) ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ మరియు సింగిల్-సెల్ సీక్వెన్సింగ్ పాన్-క్యాన్సర్ డేటా రెండూ వర్తింపజేయబడ్డాయి. MMP-ఆధారిత డయాగ్నస్టిక్ మోడల్ LASSO రిగ్రెషన్ విశ్లేషణ ద్వారా నిర్మించబడింది. కణితులను ssGSEA ద్వారా MMP స్కోర్-అధిక మరియు తక్కువ సమూహాలుగా వర్గీకరించారు . సెరాట్ ప్యాకేజీ ద్వారా సింగిల్-సెల్ డేటా విశ్లేషించబడింది. MMPల వ్యక్తీకరణ అక్షరాలు qRT-PCR ద్వారా ధృవీకరించబడ్డాయి.

ఫలితాలు: MMP1 , MMP11 , మరియు MMP12 దాదాపు అన్ని క్యాన్సర్లలో నియంత్రించబడ్డాయి. MMP19 మరియు MMP27 ఎనిమిది నుండి తొమ్మిది క్యాన్సర్ రకాల్లో గణనీయంగా నియంత్రణలో ఉన్నాయి. సహసంబంధ విశ్లేషణ MMP వ్యక్తీకరణ మరియు కణితి రోగనిరోధకత మరియు కణితి కాండం మధ్య సంభావ్య సంబంధాన్ని నిరూపించింది . మాక్రోఫేజెస్, టైప్ II IFN రెస్పాన్స్ మరియు ట్రెగ్‌తో సహా రోగనిరోధక కణాలు MMP స్కోర్-తక్కువ సమూహంలో ఊహించిన విధంగా ఎక్కువగా చొరబడ్డాయి , హిప్పో సిగ్నలింగ్ పాత్‌వే, వాస్కులర్ ఎండోథెలియల్ సెల్‌కు ల్యూకోసైట్ సంశ్లేషణ యొక్క సానుకూల నియంత్రణతో సహా విధులు, T సెల్ కీమో టాక్సీలు MMP స్కోర్‌లో మరింత చురుకుగా ఉంటాయి- అధిక సమూహం. సింగిల్-సెల్ విశ్లేషణ వివిధ సెల్ క్లస్టర్‌లలో విభిన్న MMP వ్యక్తీకరణల నమూనాను వెల్లడించింది. దీనిలో, MMP7 మాక్రోఫేజ్‌లలో ఎక్కువగా వ్యక్తీకరించబడినట్లు మరియు MMP2 CD8 ⁺ T కణాలలో ఎక్కువగా వ్యక్తీకరించబడినట్లు కనుగొనబడింది .

ముగింపు: MMPలలో ఎక్కువ భాగం క్యాన్సర్‌లలో వ్యక్తీకరణను పెంచింది, MMPలు కలయికలో సంభావ్య విశ్లేషణ విలువను చూపించాయి.