కీమోథెరపీ: ఓపెన్ యాక్సెస్
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

క్రోన్'స్ వ్యాధిలో mRNA 3′ UTR మరియు mRNA స్థాయి వ్యత్యాసాన్ని గుర్తించడానికి ఒక నవల వ్యూహం

తువో హు, హువా-షాన్ లియు, చి జౌ, జియాన్-రూయ్ వు, యు-ఫెంగ్ చెన్, జువాన్-హుయ్ లియు, జియావో-వెన్ హీ, యి-ఫెంగ్ జూ, జియావో-షెంగ్ హే, జియావో-జియాన్ వు, పింగ్ లాన్ మరియు జియా కే

వియుక్త నేపథ్యం మరియు లక్ష్యాలు: క్రోన్'స్ వ్యాధి (CD) అనేది దీర్ఘకాలిక మరియు వక్రీభవన ప్రేగు సంబంధిత శోథ వ్యాధి. mRNA ట్రాన్స్క్రిప్ట్ యొక్క 3′ అనువదించబడని ప్రాంతం (3′ UTR) ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్ తర్వాత దాని స్వంత అనువాద ప్రక్రియను నియంత్రించగలదు మరియు CDలో దాని పాత్ర అస్పష్టంగానే ఉంది. mRNA 3′ UTR నియంత్రణ ద్వారా CD ఫినోటైప్‌ను ప్రభావితం చేసే క్లిష్టమైన జన్యువులను గుర్తించడం ఈ అధ్యయనం యొక్క లక్ష్యం. పద్ధతులు: RNA-seq ఆధారిత ఆన్‌లైన్ CD డేటాబేస్ నుండి మొత్తం ట్రాన్సిప్టోమ్ యొక్క 3′ UTR పొడవును అంచనా వేయడానికి Isoform స్ట్రక్చరల్ చేంజ్ మోడల్ (IsoSCM) ఉపయోగించబడింది. 3′ UTR పొడవు స్థితి మరియు mRNA స్థాయి మధ్య సహసంబంధాలు స్పియర్‌మ్యాన్ కోఎఫీషియంట్స్ ద్వారా విశ్లేషించబడ్డాయి. పరస్పర సంబంధం ఉన్న జన్యువుల జాబితా ప్రచురించబడిన క్లిష్టమైన CD సంబంధిత జన్యు జాబితాతో అతివ్యాప్తి చేయబడింది. CD ఫినోటైప్‌తో అనుబంధించబడిన జన్యువులను గుర్తించడానికి ఏకరూప మరియు మల్టీవియారిట్ విశ్లేషణలు జరిగాయి. ఫలితాలు: సాధారణ నియంత్రణతో పోలిస్తే, 34192 జన్యువులలో 3′ UTR కుదించబడింది మరియు CD రోగులలో 432784 జన్యువులలో 57389 పొడిగించబడ్డాయి. 255 జన్యువుల 3′ UTR మార్పులు వాటి mRNA స్థాయితో గణనీయంగా సంబంధం కలిగి ఉన్నట్లు కనుగొనబడింది. ఇంకా, 8 అతివ్యాప్తి చెందిన జన్యువులు 255 కంటే ఎక్కువ పరస్పర సంబంధం ఉన్న జన్యువులు మరియు తెలిసిన CD సంబంధిత జన్యు జాబితా (ABCB1, FAF1, TUT2, IL27, JAK2, LTB, NAGLU మరియు PTPN2) ద్వారా భాగస్వామ్యం చేయబడ్డాయి. ABCB1 మరియు JAK2 యొక్క mRNA స్థాయి, మరియు JAK2 ట్రాన్స్క్రిప్ట్ యొక్క 3′ UTR పొడవును తగ్గించడం CD రోగులలో లోతైన పుండుతో ఏకరూప మరియు బహుళ విశ్లేషణ ద్వారా పరస్పర సంబంధం కలిగి ఉన్నట్లు కనుగొనబడింది. తీర్మానాలు: CD సంబంధిత జన్యువుల 3′ UTR మార్పులు CD యొక్క సమలక్షణానికి సంబంధించినవిగా నిర్ధారించబడ్డాయి. CD కోసం బాహ్యజన్యు విధానాలు మరియు చికిత్సా వ్యూహాలపై మా పరిశోధనలు మరింత అంతర్దృష్టిని అందించవచ్చు.