జర్నల్ ఆఫ్ థియరిటికల్ & కంప్యూటేషనల్ సైన్స్
అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

K-సమీప పొరుగు మాలిక్యులర్ ఫీల్డ్ విశ్లేషణను ఉపయోగించి కార్బాక్సిల్ ఎస్టేరేస్ ఇన్హిబిటర్స్ వలె ఇసాటిన్ డెరివేటివ్‌లపై 3D QSAR విశ్లేషణ

సన్మతి KJ, అచల్ M

k సమీప పొరుగు మాలిక్యులర్ ఫీల్డ్ అనాలిసిస్ (kNN MFA) పద్ధతిని ఉపయోగించి త్రీ డైమెన్షనల్ క్వాంటిటేటివ్ స్ట్రక్చర్ యాక్టివిటీ రిలేషన్‌షిప్ (3D QSAR) కార్బాక్సిలెస్టరేస్ (CE) ఇన్‌హిబిటర్‌లుగా ఇసాటిన్ డెరివేటివ్‌ల శ్రేణిలో ప్రదర్శించబడింది. ఈ అధ్యయనం 49 సమ్మేళనాలతో (డేటా సెట్) స్పియర్ ఎక్స్‌క్లూజన్ (SE) అల్గోరిథం ఉపయోగించి డేటా సెట్‌ను శిక్షణ మరియు పరీక్ష సెట్‌గా విభజించడం కోసం నిర్వహించబడింది. SE అల్గారిథమ్ ప్రాతినిధ్య పాయింట్లచే ఆక్రమించబడిన అన్ని డిస్క్రిప్టర్ స్పేస్ ప్రాంతాలను కవర్ చేసే శిక్షణా సెట్‌లను నిర్మించడానికి అనుమతిస్తుంది. 3.0 నుండి 5.5 అసమానత స్థాయిల మధ్య, పరీక్ష సెట్ పరిమాణం 4 నుండి 10 వరకు, kNN-MFA మెథడాలజీతో స్టెప్‌వైస్ (SW), సిమ్యులేటెడ్ ఎనియలింగ్ (SA) మరియు జెనెటిక్ అల్గారిథమ్ (GA) QSAR మోడల్‌లను రూపొందించడానికి ఉపయోగించబడింది. నాలుగు ప్రిడిక్టివ్ మోడల్‌లు SW-kNN MFAతో రూపొందించబడ్డాయి (pred_r2=0.7552 నుండి 0.9376 వరకు), మూడు ప్రిడిక్టివ్ మోడల్‌లు SA-kNN MFAతో రూపొందించబడ్డాయి (pred_r2=0.7019 నుండి 0.9367 వరకు) మరియు రెండు ప్రిడిక్టివ్ మోడల్‌లు GA-kN2=0.0.7019 నుండి 0.9367 వరకు రూపొందించబడ్డాయి. కు 0.8497). స్టెప్‌వైస్ kNNMFA ద్వారా రూపొందించబడిన అత్యంత ముఖ్యమైన మోడల్ అంతర్గత అంచనా 82.11% (q2=0.8211) మరియు బాహ్య అంచనా 93.76% (q2=0.9376) చూపించింది. ఈ మోడల్‌లో హైడ్రోఫోబిక్ మరియు స్టెరిక్ ఇంటరాక్షన్‌లు CE నిరోధక చర్యలో ఆధిపత్యం చెలాయిస్తాయి. సానుకూల శ్రేణితో హైడ్రోఫోబిక్ ఫీల్డ్ డిస్క్రిప్టర్ (H_977) సానుకూల హైడ్రోఫోబిక్ సంభావ్యత కార్యకలాపాల పెరుగుదలకు అనుకూలంగా ఉంటుందని సూచిస్తుంది మరియు అందువల్ల ఆ ప్రాంతంలో ఎక్కువ హైడ్రోఫోబిక్ ప్రత్యామ్నాయ సమూహానికి ప్రాధాన్యత ఇవ్వబడుతుంది. ప్రతికూల శ్రేణితో ఉన్న స్టెరిక్ ఫీల్డ్ డిస్క్రిప్టర్ (S_619) ప్రతికూల స్టెరిక్ పొటెన్షియల్ అనేది యాక్టివిటీని పెంచడానికి అనుకూలంగా ఉంటుందని సూచిస్తుంది మరియు అందువల్ల ఆ ప్రాంతంలో తక్కువ స్థూలమైన ప్రత్యామ్నాయ సమూహానికి ప్రాధాన్యత ఇవ్వబడుతుంది. kNN-MFA ఆకృతి ప్లాట్లు ప్రత్యామ్నాయ ఐసాటిన్ డెరివేటివ్‌ల యొక్క నిర్మాణ లక్షణాలు మరియు కొత్త సంభావ్య CE ఇన్హిబిటర్‌లను రూపొందించడానికి వర్తించే వాటి కార్యకలాపాల మధ్య సంబంధాన్ని మరింత అర్థం చేసుకున్నాయి.